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第二章蛋白质的想结构与功能
第二章 蛋白质的结构与功能Structure and Function of Protein 第一节 蛋白质的分子组成 蛋白质的元素组成: 碳 50%~55% 氧 19%~24% 氮 13%~19%(平均16%) 氢 6%~7% 硫 0~4% 个别蛋白质含磷或金属元素 定氮法测定样品中的蛋白质含量 每克样品中的蛋白质含量为: 每克样品中的含氮量 16 一、蛋白质的基本组成单位L- α-氨基酸 (一)氨基酸(amino acid)的结构(通式) 。 非极性疏水性氨基酸 极性中性氨基酸 酸性氨基酸 酸性氨基酸 中性氨基酸按R基团的结构不同分为: 脂肪族氨基酸 含硫氨基酸 芳香族氨基酸 亚氨基酸 羟基氨基酸 酰胺类氨基酸 脂肪族氨基酸(5种) 芳香族氨基酸(3种) 羟基氨基酸( 2种) 含硫氨基酸( 2种) 亚氨基酸(1种) 酰胺类氨基酸(2种) (三)氨基酸的理化性质 氨基酸的两性解离与等电点 氨基酸的两性解离 等电点(isoelectric point,pI) 氨基酸在某一溶液中,所带的正负电荷相等时的pH值,即为这种氨基酸的等电点 紫外吸收性质 茚三酮反应(ninhydrin reaction) 二、氨基酸在蛋白质分子中的连接方式 —肽键(peptide bond),即酰胺键 (一)肽键及肽 (二)肽的书写及其命名 书写原则 命名原则 肽的分类 寡肽(oligopeptide):氨基酸残基数小于10 多肽(polypeptide):氨基酸残基数小于50 蛋白质(protein):氨基酸残基数大于50 三、生物活性肽(biological active peptide)) γ-谷胱甘肽( γ-glutathione,GSH) γ-谷胱甘肽具有抗氧化功能 第二节 蛋白质的分子结构 从不同的层面上可将蛋白质的 分子结构分为: 一级结构 二级结构 三级结构 四级结构 一、蛋白质的一级结构 (一)蛋白质一级结构的概念 蛋白质的一级结构(primary structure)是指 蛋白质分子中多肽链的氨基酸排列顺序。一级 结构的化学键是肽键。一级结构是蛋白质的基 本结构,它是蛋白质空间结构和特异功能的基 础。 Insulin 1953 Frederick Sanger 1965 Scientist in our country Success, Pity! 蛋白质的空间结构——构象 蛋白质的多肽链经过其分子内部众多基团的折叠盘曲,形成特定的三维空间结构,即称为构象。空间结构决定着蛋白质的理化性质及功能。 蛋白质的空间结构包括二级结构、三级结构 和四级结构 (一)蛋白质的二级结构 蛋白质的二级结构(secondary structure)是指蛋白质分子中多肽链主链原子中的局部空间分布状态,即多肽链主链原子的空间构象,不涉及侧链原子的空间排布。 肽单元(peptide unit): C—N单键的键长为0.147nm,C==N双键的键长为 0.128nm,肽键C–N的键长为0.132nm,介于单键与 双键之间,偏向于双键,不能扭转。 肽键的两个原子与其相连的三个原子间的键角之 和为360°,所以,肽键周围的6个原子在一个平 面上,此平面称为肽单元。或称肽键平面 肽单元构成蛋白质主链空间构象的基本单位是肽 单元 (二)蛋白质二级结构 主要构象形式: ?-螺旋、 ?-折叠( ?-片层) ?-转角 无规卷曲 ?-螺旋( ? -helix) ?-螺旋的的主要特点 ?-螺旋结构是以肽平面单位形成的右手螺旋结构, 每3.6个氨基酸螺旋上升一周,螺距为0.54nm。 每个肽平面的N-H与第4个肽平面的C-O形成氢键。氢键氢键之间共包含13个原子。与螺旋长轴相平行。 ?-螺旋的所有肽键均参与氢键的形成。R基团伸向螺旋的外侧。 维持?-螺旋结构稳定的因素是氢键。 ?-折叠( ? -pleated sheet) ?-折叠主要特点 1.?-折叠结构呈折纸样,多肽 链充分伸展,肽平面之间折叠 成锯齿样结构。 2.?-折叠结构的肽端常常2 个以上的?-折叠平行排列,肽 段之间形成氢键。即一个肽链 的肽键羰基氧与另一肽链的肽 键氨基氢形成氢键。所有的肽 键均参加氢键的形成。
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