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生物化学对和分子生物学3
重组DNA技术 DNA重组的基本模式 (分)------目的基因及载体的分离 化学合成 基因组文库 cDNA文库 聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR) 载体DNA的选择 质粒载体的一般结构 切------限制性内切酶酶切 载体和目的基因的切断 通常采用限制性核酸内切酶(restriction endonuclease),简称限制酶,分别对载体DNA和目的基因进行切断,以便于重组。 限制酶目前已经发现400多种,所识别的顺序往往为4-8个碱基对,且有回文结构。 由限制酶切断后的末端可形成平端、3-突出粘性末端和5-突出粘性末端三种情况。形成粘性末端(cohesive end)者较有利于载体DNA和目的基因的重组。 接------载体和目的基因的连接 (二)人工接尾法: 即同聚物加尾连接法。当载体和目的基因无法采用同一种限制酶进行切断,无法得到相同得粘性末端时,可采用此方法。 此法首先使用单链核酸酶将粘性末端切平,再在末端核苷酸转移酶的催化下,将脱氧核糖核苷酸添加于载体或目的基因的3-端,如载体上添加一段polyG,则可在目的基因上添加一段polyC,故二者即可通过碱基互补进行粘合,再由DNA连接酶连接。 (三)人工接头连接法: 将人工连接器(linker,即一段人工合成的含有多种限制酶切点的小分子DNA片段,约10~20个核苷酸, )连接到平末端DNA分子(载体和目的基因)上,即有可能使用同一种限制酶对载体和目的基因进行切断,得到可以互补的粘性末端。 这种方法的优点是克隆位点具有限制酶的酶切位点。 转------重组体的转化 宿主菌或受体细胞 感受态细胞(competent cell) 真核细胞的转染 重组体克隆的筛选与鉴定 阳性重组子的筛选与鉴定 1、遗传检测法(根据重组载体的标志作筛选) ------插入失活法 ------α-互补法 2. 限制性酶切法 3. PCR法 4.杂交筛选法 5.免疫学方 法 6. 核苷酸序列测定法 遗传检测法 现在使用的许多载体(如PUC系列)有含有一个大肠杆菌DNA的短区段,其中含有β-半乳糖苷酶基因(lacZ)的调控序列和N端146个氨基酸偏码区(全长1201氨基酸) 。这个编码区中插入一个多克隆位点。 受体菌是Z基因突变型,只含编码β-半乳糖苷酶C端aa的序列。当外源基因插入时,在IPTG (异丙基硫代-β-D-半乳糖苷)诱导下合成β-半乳糖苷酶N端片断,和受体菌的C端片断溶为一体后,可产生蛋白质间的互补,形成有活性的β-半乳糖苷酶,称α互补。 具有α互补的细菌培养在含IPTG及X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷)的培养基上. X-gal本身是无色的,在半乳糖苷酶的水解下产生兰色的物质(被水解为无色的半乳糖及深兰色的5-溴-4-氯靛兰),因此会形成蓝色菌落。 而当有外源基因插入到多克隆原点,从而造成插入突变失活,则不能产生α互补,因此菌落是白色的。通过颜色不同而区分重组子和非重组子。 IPTG起诱导表达的作用,相当于乳糖,但它的诱导效率远高于乳糖。 限制性酶切法 杂交筛选法 免疫化学检测法 DNA序列分析法 外源基因在宿主细胞中的表达 原核生物基因结构和表达特点 影响外源基因在原核细胞中表达效率的因素: 基因工程用于生产蛋白质类药物 治疗糖尿病的胰岛素,是一种 51 个氨基酸残基组成的蛋白质 1982 年美国 EliLilly 公司推出基因工程制造的人胰岛素,商品名为(Humulin)。 干扰素用于治疗肝炎等病毒感染性疾病,有良好疗效。 1 升发酵液中所得的干扰素相当于过去从 1000 升人血中所得。生产成本也大为降低。 目前用基因工程生产的蛋白质药物已达数十种,许多以前本不可能大量生产的生长因子,凝血因子等蛋白质药物,现在用基因工程办法便可能大量生产。 PCR法 利用的目标引物(例如分离目的基因所使用的引物), 抽提需要筛选的克隆的重组DNA作为模板, 进行PCR扩增,根据是否扩增出目的片段来确定阳性克隆. 为了进一步鉴定重组基因体中的目的基因,可采用与目的基因部分互补的DNA片段作为探针,与含有重组体的细菌菌落进行杂交,经放射自显影,如结果为阳性,即可确定重组体中带目的基因。 32P标记的DNA分子探针 杂交 放射自显影法 分子杂交 依据:碱基互补配对原则 ①合成核酸探针(与所需基因互补的核苷酸短链,并用同位素标记) ②升高温度或改变pH使DNA变性 ③分子杂交(常用原位分子杂交)如果基因文库中的一个DNA片段能和探针结合形成双链,这一片段即含有所需基因。 步骤: 滤膜(固定抗体) + 该方法通常是用在目的基因筛选
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