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分子生物学第二章宽dna结构与功能
2 DNA结构与功能 主 要 内 容 染色体 DNA的结构 DNA的复制 DNA的修复 DNA的转座 一、染色体(Chromosome) (三)染色体的结构和组成 原核生物(prokaryote) 1、组蛋白(histone) 真核生物染色体的基本结构蛋白 富含带正电荷的Arg和Lys等碱性氨基酸 碱性蛋白质 可以和酸性的DNA紧密结合(非特异性结合); 组蛋白的一般特性: i) 进化极端保守性: 不同种生物组蛋白的氨基酸组成十分相似。 其中H3、H4最保守; H2A、H2B变化相对大; H1变化更大。 H3、H4可能对稳定真核生物的染色体结构起重要作用。 保守程度:H1 H2A、H2B H3 、H4 ii)无种属组织特异性: 到目前为止,仅发现鸟类、鱼类及两栖类红细胞染色体不含H1而带有H5; 精细胞染色体的组蛋白是鱼精蛋白。 iii)肽链氨基酸分布的不对称性 碱性氨基酸集中分布在N端的半条链上,大部分疏水基团分布在C端; 可能与它们的功能相互作用有关: 碱性的半条链易与DNA的负电荷区结合,而另外半条链与其它组蛋白、非组蛋白结合。 iv)H5组蛋白的特殊性: 富含赖氨酸(24%)、丙氨酸(16%)、丝氨酸(13%)、精氨酸(11%)。 H5的磷酸化可能在染色质失活过程中起重要作用。 在细胞周期特定时间可发生甲基化、乙酰化、磷酸化和ADP核糖基化等。 H3、H4修饰作用较普遍,H2B有乙酰化作用、H1有磷酸化作用。 H2A、H2B、H1不明显。 修饰作用的特点: ——降低组蛋白所携带的正电荷。 组蛋白修饰的意义: 一是改变染色体的结构,直接影响转录活性; 二是核小体表面发生改变,使其它调控蛋白易于和染色质相互接触,从而间接影响转录活性。 2.非组蛋白 占组蛋白总量的60%-70%,种类很多,20-100种,常见有15-20种; 包括酶类、如RNA聚合酶及与细胞分裂有关的收缩蛋白、骨架蛋白、核孔复合物以及肌动蛋白、肌球蛋白、微管蛋白、原肌蛋白等。 可能是染色质的结构部分。 高速泳动(high mobility group protein, HMG)蛋白: ——能与DNA结合,也能与H1结合,可能与DNA的超螺旋结构有关。 DNA结合蛋白: 能是一些与DNA的复制或转录有关的酶或调节物质。 A24非组蛋白: 其C端与H2A相同,但它有两个N端,一个N端的序列与H2A相同,另一个与泛素相同;其大小与H2A差不多,酸性,含较多的谷氨酸和天冬氨酸,位于核小体内,功能不祥。 非组蛋白 ?非组蛋白具多样性和异质性 ?对DNA具有识别特异性,又称序列特异性DNA结合蛋白 (sequence specific DNA binding proteins) ?具有多种功能,包括基因表达的调控和染色质高级结构的形成。 C值: 是一种生物的单倍体基因组DNA的总量。 C值反常现象(C-value paradox)/ C值矛盾: 真核细胞基因组的最大特点是它含有大量的重复序列,而且功能DNA序列大多被不编码蛋白质的非功能DNA所隔开,这就是著名的“C值反常现象”。 Genome: all DNA sequences in a cell Genes: a stretch of continuous DNA sequence encoding a protein or RNA C-value is the quantity of DNA in the genome (per haploid set of chromosomes). C-value paradox (C值矛盾) refers to the lack of a correlation between genome size and genetic complexity 在真核生物中C值一般是随生物进化而增加的,高等生物的C值一般大于低等生物。 然而,某些两栖类的C值甚至比哺乳动物还大,而在两栖类中C值的变化也很大,可相差100倍。 由此推断,许多DNA序列可能不编码蛋白质,是无生理功能的。 C值反常现象/C值矛盾: 指C值与种系进化复杂性不一致的现象。 简述DNA的C值以及C值矛盾(C Value paradox). 中科院上海生化所 98 年 上海第二军医大
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