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两品种鸡发生长模型探析及pgc

扬州大学 硕士学位论文 两品种鸡生长模型探析及PGC--1α基因与肉品质及其相关基因 表达的关联分析 姓名:刘宏祥 申请学位级别:硕士 专业:动物遗传育种 指导教师:陈宽维;王金玉mII mII Ill IIll[III lilt II Ill Y20501 39 两品种鸡生长模型探析及PGC.1 Q基因与肉品质及 其相关基因表达的关联分析 摘要 以我国著名优质地方品种清远麻鸡和国外引进的快大型品种隐性白羽鸡为研 究对象,用Logistic模型、Gompertz模型和Von Bertahnffy模型对体重和胫长进行 了生长曲线的拟合,并比较了3种模型拟合效果的优劣;测定了肌内脂肪含量、 剪切力和胸肌失水率等肉品质指标:对影响肉品质的一个关键候选基因PGC.1 Q (peroxisome pro liferators activated receptor gamma coactivator·I alpha,过氧化物酶 体增殖物活化受体Y辅激活因子1.Q)进行SNP位点筛查,并与肉质性状进行关 联分析,找出对肉品质有重要影响的多态性位点;分析了PCrC.1 a基因以及与肌 纤维类型相关的不同亚型的肌球蛋白重链(MyHC)基因(FWM(fast whight muscle) 基因、FRM(fast red muscle)基因和SM(slow musele)基因)在肌肉组织中的发 育表达规律,并分析了PGC.1 a基因表达与FWM基因、FILM基因和SM基因的 相关性。主要研究结果如下: 1.用Logistc模型、Gompertz模型和Von Bertalanffy模型对隐性白羽鸡和清远 麻鸡的体重和胫长进行生长曲线拟合,发现0周龄.4周龄隐性白羽鸡的体重用Von Bertalanffy模型拟合效果最好,5周龄.14周龄隐形白羽鸡的体重以及0周龄.14周 龄清远麻鸡的体重用Gompertz模型拟合效果最好。隐性白羽鸡和清远麻鸡的胫长 均是Logistci模型的拟合效果最好。 2.Gompertz模型对隐性白公、母鸡和清远麻公、母鸡体重拟合的拐点周龄分 别为8.6周龄、8.6周龄、8.5周龄和9.0周龄,四者相差不大。Logistic模型对隐 性白公、母鸡和清远麻公、母鸡胫长拟合的拐点周龄分别为4.2周龄、4.0周龄、 4.2周龄和3.6周龄,四者相差也不大。隐性白的最大周增重比清远麻的最大周增 重约100 g。 3.各周龄的体重和胫长的相关分析表明,2周龄的体重与3周龄.14周龄的体 3.各周龄的体重和胫长的相关分析表明,2周龄的体重与3周龄.14周龄的体 重之间的相关均极显著(Po.01),R2值为0.8;3周龄的胫长与3周龄.14周龄的体 重之间的相关也均极显著(P0.01),R2值为0.8,因此可以通过对早期体重和胫长 的个体选择,达到挑选出上市日龄较大体重的目的。 4.用PCR.SSCP结合直接测序法对PGC.1 a基因13个外显子和部分内含子进 行SNP位点筛查,与Genbank中的DNA序列(登录号:NW 001471687)比对, 共发现了13个突变位点,分别是:sNP 0(G5407189A)、SNP l(G5368254A)、 SNP 2(C5377373T)、SNP 3(C5405129T)、SNP 4-l(T54061 52C)、sNP 4—2 (A5406203G)、SNP 5(G5407235A)、SNP 6.1(C541 1336T)、SNP 6.2(A541 1345G)、 SNP 8(A5419140G)、研岬13(G5420542A)、SNP 14(T5420953C)和sNP 15 (G5430392A)。其中SNP 0、SNP 2、SNP 3、SNP 4.1、SNP 6.1、sNP6.2和SNP 8位点处于外显子中,属于沉默突变;SN-P 4-2、SNP5和SNP 15位点处于外显子 中,分别导致了氨基酸序列Ri73G、D216N和R673H的变异;SNP 1、SNP 13和 SNP 14位点处于内含子中。 隐性白和清远麻两个品种中各突变位点的基因型分布均符合哈代.温伯平衡定 律(Po.05);品种之间除了SNP 8位点外,其他位点基因型分布差异均极显著。 两个品种各突变位点的优势等位基因相同。隐性白羽鸡和清远麻鸡PGC.1 Q基因 的平均多态信息含量含量分别为0.088和0.133,属于低度多态位点。 5.隐性白羽鸡和清远麻鸡肉品质的分析 对7周龄隐性白公母鸡、17周龄隐性自公母鸡和17周龄清远麻公母鸡进行常 规肉品质检测与分析。7周龄隐性白公、母鸡之间肌内脂肪含量、剪切力和胸肌失 水率差异均不显著;17周龄隐性白公鸡的剪切力极显著高于母鸡的,胸肌失

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