草莓轻型黄边病毒北京分离物的CP基因序列分析.PDFVIP

中国农学通报 2015,31(3):229-233 Chinese Agricultural Science Bulletin 草莓轻型黄边病毒北京分离物的CP基因序列分析 1 1 1 2 3 陈 柳 ，冉 策 ，尚巧霞 ，陈笑瑜 ，邢冬梅 ， 1 1 4 李永强 ，杨 瑞 ，韩成贵 1 （农业应用新技术北京市重点实验室/北京农学院植物科学技术学院，北京102206； 2 3 北京市植物保护站，北京100029；北京市昌平区植保植检站，北京102200； 4 国家农业生物技术重点实验室/ 中国农业大学农学与生物技术学院，北京100193） 摘 要：为了明确引起北京地区草莓病毒病的病毒种类和病毒序列的分子变异特点，从北京地区表现畸 形症状的草莓叶片中提取总RNA ，利用RT-PCR 技术扩增得到草莓轻型黄边病毒(Strawberrymildyellow edgevirus，SMYEV)的含有外壳蛋白(CP)基因的729 nt 特异性核苷酸片段。经序列测定和分析可知，北 京地区存在2 种不同的SMYEV 分离物（BJ 1 和BJ2 ），两者间的核苷酸序列同源性仅为82.72%~ 82.96% 。将北京分离物与分别来自德国、美国、智利、捷克、澳大利亚、比利时、意大利、韩国和中国沈阳 等国家或地区的不同分离物的CP 基因序列进行分析比较。结果显示，33 个分离物可以分为四大组群， BJI 和BJ2 分别归属不同组群，BJ 1与19 个其他国家的分离物亲缘关系较近，BJ2 与中国沈阳的2 个分离 物亲缘关系较近。BJ 1 和BJ2 与其他分离物的CP 基因核苷酸序列同源性分别为81.10%~98.35%和 82.03%~98.63% ，氨基酸序列同源性介于82.17%~99.17%和90.91%~94.63%。 关键词：草莓轻型黄边病毒；RT-PCR ；CP 基因；序列分析 中图分类号：S432.4+ 1 文献标志码：A 论文编号：2014-2514 SequenceAnalysisofCPGeneofDifferentIsolatesofStrawberrymildyellowedgevirus fromBeijinginChina 1 1 1 2 3 ChenLiu,RanCe,ShangQiaoxia,ChenXiaoyu,XingDongmei, LiYongqiang,YangRui,HanChenggui1 1 4 1 (BeijingKeyLaboratoryofNewTechnologyinAgriculturalApplication/ CollegeofPlantScienceandTechnology,BeijingUniversityofAgriculture,Beijing102206;