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功能基因研究策略及工具
-高通量筛选及相关技术
季博
博士、技术总监
吉凯基因科技
2011年5月
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功能基因研究流程
提出问题
基因
功能
机制
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肿瘤基因功能研究流程推进
肿瘤 第一步:由特定肿瘤找出相关基因
表达检测
基因 常规方法:表达芯片,蛋白芯片,质谱检测
目的:通过筛选,找出在肿瘤组织中有表达,和肿瘤的
临床特征有相关性的基因
功能 意义:研究的应用性以及临床相关性
机制
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肿瘤基因功能研究流程推进
肿瘤 第二步:确定候选基因的生物学功能
基本逻辑:改变基因状态后检测细胞模型、动物模型
的表型变化
基因
基因操作 基因操作常规方法:过表达,RNAi
功能检测 功能检测方向:增殖凋亡,转移,血管新生等
功能
目标:确定候选肿瘤相关基因的生物学功能
机制
意义:研究的重要性
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肿瘤基因功能研究流程推进
肿瘤
第三步:确定基因行使功能的分子机制
常规思路:检测下游基因的变化,包括表达修饰等
基因
常用方法:表达芯片,蛋白芯片等
目标:找出受目的基因影响的发生改变的下游分子
功能 意义:决定了文章的深入程度
下游分子检测
机制
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不同阶段研究者推进过程解决方案
已确定肿瘤研究方向,手头有组织样
肿瘤 本,但未确定目的基因的研究者
芯片技术
表达芯片获得候
确定单个目的基因
基因 选基因列表
细胞模型 RNAi
高通量筛选
动物模型 功能检测
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