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混合离子溶液中RNA离子凝聚竞争和RNA赝结结构柔性的研究.PDF
混合离子溶液中RNA离子凝聚竞争和
RNA赝结结构柔性的研究
席 昆
二零一八年六月于珞珈山
目 录
研究背景
混合离子溶液中的离子对核酸的竞争凝聚
H型RNA赝结的柔性及其中离子效应研究
碱基修饰对核酸碱基对稳定性的影响研究
全文总结
研究背景
核小体
组成核苷酸的三个部分:
含氮碱基、五碳糖和磷酸基团 mRNA rRNA tRNA
/wiki/Nucleotide; /wiki/Nucleic_acid; /wiki/RNA
研究背景
细胞内 实验结果
Na+
Mg2+
K+
5 mM Mg2+ 20 mM Na+
2+ + +
核酸分子一般处于单价/双价混合离子溶液中(如Mg 、Na 和K )
Yu Bai et. al, J. Am. Chem. Soc. , 129, 14981-14988, 2007
混合离子溶液中的离子对核酸的竞争凝聚
2+
Δ [Mg ]
~ 44%
2+
[Mg ]desired bulk
2+
Δ [Mg ]
~ 5.1%
2+
[Mg ]desired bulk
是否存在普适的方法快
速得到期望的离子体浓
度?
Yoo et. al, J. Phys. Chem. B , 116, 12946-12954, 2012; Hayes et. al, J. Am. Chem. Soc. , 134, 12043-12053, 2012;
混合离子溶液中的离子对核酸的竞争凝聚
单价和双价离子对核酸中和能力等效公式
+ 2+
log [Na ]Mg A log[Mg ] + B
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