《molecuar cell biology》Chapter 10.3 Mobile DNA.pptVIP

Chapter 10.3 Mobile DNA;目录;逆转录转座子;不包含LTR的逆转录转座子;不包含LTR的逆转录转座子;人类DNA包含LINE序列的三个主要家族：L1、L2和L3。这三个主要家族转座机制相似，但是序列不同。 在当代人类基因组中只有L1家族成员能够转移。 LINE序列在人类基因组中约90万个位点上出现，占了接近整个人类DNA的21%。;LINEs（长散在重复元件）;LINEs（长散在重复元件）;LINEs（长散在重复元件）;LINEs（长散在重复元件）;LINEs（长散在重复元件）;LINEs（长散在重复元件）;LINEs（长散在重复元件）;SINEs（短散在重复元件）;SINEs（短散在重复元件）;串联重复基因;复制（duplication） 即复制后基因发生序列变化而失去功能，这样产生的假基因带有内含子，称为non-processed或duplicated pseudogenes。 返座/逆转录转座（retrotransposition） 即mRNA转录本经过反转录为cDNA,再插入基因组，由于插入位点不合适或序列发生变化而导致失去功能。这种类型的假基因不含内含子，被称为processed pseudogenes或retropseudogene。 大多数加工假基因的两侧是短正向重复序列;可移动DNA元件在进化中的深远意义;在高等真核生物进化过程中，遍布整个祖先基因组的可移动DNA元件之间的同源重组可能会产生基因复制或者其他DNA序列的重排。 位于一个特定基因的内含子里的可移动元件间的不均等交换可能会导致该基因里的外显子复制。这个过程最可能影响一些包含编码相似蛋白子结构域的相似外显子的多重拷贝基因的进化，例如纤连蛋白。 ; ;可移动DNA元件在进化中的深远意义;可移动DNA元件在进化中的深远意义;两侧带有同源DNA转座子的外显子转座到第二个基因的内含子里。就如我们在图10-10第一步中看到的一样，转座酶可以识别和切除转座子反向重复序列末端的DNA。在基因1中，如果转座酶在左边切除转座子的左末端，在右边切除转座子的右末端，转座酶就可以调换所有的中介DNA，包括转移来自基因1的外显子到基因2的一个内含子中的新位点。;可移动DNA元件在进化中的深远意义;除了引起基因组中编码序列的变化之外，可移动元件间的重组和毗连DNA转座子和逆转座子的DNA的转座在控制基因表达的调节序列的进化过程中起着重要作用。 正如前面所提到的，真核生物的基因组拥有转录控制区域，被称之为增强子。增强子能够越过数以万计的碱基对的距离进行操控。很多基因的转录是通过一些增强子的联合作用控制的。转录控制区域附近的可移动元件的插入很有可能有助于增强子序列的新组合的进化。;可移动DNA元件在进化中的深远意义;;4;7;10;文献 1;文献 1;题目：Identification of a family of SINEs and LINEs in the Pipistrellus kuhli genome：A new structural and functional symbiotic relationship （白边油蝠基因组中SINEs和LINEs家族的鉴定：一个新的结构和功能的相互关系） 作者：Stefania Fantaccione, Pasqualina Woodrow, Giovanni Pontecorvo 作者单位：Department of Life Science, II University of Naples, Via Vivaldi 43, 81100 Caserta, Italy 文献来源：Genomics 91 (2008) 178–185 ;文献 2;摘要：我们最初描述了一个源自tRNA的异常SINE家族。该家族大量随机分布在白边油蝠的基因组中。现已证明LINE逆转录转座机制是用来解释一个假想的由部分LINE逆转录酶ORF2构成的新逆转录物的产生。SINE15和智人螺旋六7SL RNA之间有结构同源性，这让我们进一步提出SINE逆转录转座子的多基因组协作物，例如SRP蛋白和LINE酶机制。此外，在假想SINE/LINE转录物的基础上，我们提出了SINE和LINE逆转录转座子之间的相互关系。 关键词： SINE， LINE， Pipistrellus kuhli（白边油蝠）， 7SL RNA，Chimeric transcript（假想转录物）;文献 3;文献 3;文献 3;题目：Ancient repeat sequence derived from U6 snRNA in primate genomes （在灵长类动物基因组中古老重复序列源自U6 snRNA) 作者：Manel Hasnaoui, Au