酶的作用机制和酶的活性部位调节.pptVIP

第11章 酶作用机制和酶活性调节 主要内容 酶的活性部位 酶促反应机制 酶活性的别构调节 酶活性的共价调节 同工酶 一、酶的活性部位 1.酶的活性部位（active site，活性中心active center）: 是指酶分子的表面有一个必需基团比较集中、并构成一定的空间结构的微小区域，在这里必需基团参与和底物结合并完成把底物转变成产物的化学反应。 酶活性部位：结合部位+催化部位 结合基团(binding group)：参与和底物结合的必需基团；决定酶的专一性。 催化基团(catalytic group)：催化使底物转变为产物的化学反应的必需基团；决定酶的催化能力。 必需基团： 某些氨基酸残基的侧链、有时也 包括辅酶分子或它的基团。 酶分子中的残基分为四类： 接触残基：负责底物的结合与催化 辅助残基：起协助作用； 结构残基：维持酶的构象； 非贡献残基：它的替换对活性无影响，但对酶的免疫、运输、调控与寿命等有作用。 前二者构成活性中心，前三者称为酶的必需基团。 2. 酶活性部位的一般特点 ①只占酶整体的相当小的一部分（1%~2%）。 ② 是一个三维实体。 ③ 底物结合的专一性决定于活性部位中精确地原子排列，即直接契合或诱导契合。 ④ 大多数底物都是以相当弱的力与酶活性部位结合的，这些力与稳定酶（蛋白质）三维结构的力基本相同。 ⑤ 活性部位是酶分子表面的一个空穴或裂沟。 疏水的微环境下有利于极性氨基酸残基发生结合和催化。 二、酶促反应机制 （一）基元催化的分子机制： 基元催化:是由某些基团或小分子催化的反应，包括 酸碱催化 共价催化 金属离子催化 （二）酶具有高催化能力的原因 邻近和定向效应 诱导契合和底物形变 电荷极化和多元催化 疏水的微环境的影响 （一）基元催化的分子机制 亲核催化：由亲核催化剂（多电子）加速的反应，催化剂向反应物的亲电中心（常是碳原子核）提供电子，形成共价配位键，并产生一个不稳定的共价中间产物。 酶上的亲核基团：丝氨酸羟基、半胱氨酸巯基、组氨酸咪唑基 底物的亲电中心：磷酰基、酰基和糖基。 亲电催化：由亲电催化剂（缺电子）加速的反应。通常涉及产生亲电中心的辅酶。 如以磷酸吡哆醛为辅酶的天冬氨酸转氨酶、丙氨酸消旋酶等。 3. 金属离子催化（metal ion catalysis） 需要金属的酶分类： 金属酶：含紧密结合的金属离子，主要为稳定酶的天然构象所必需，如Fe2+、Cu2+、Zn2+、Mn2+、Co2+。 金属激活酶：含松散结合的金属离子，可能只在催化期间结合，如Na+、K+、Mg2+、Ca2+。 金属离子的作用： 作为亲电催化剂稳定反应时形成的负电荷，以利于底物进入反应过渡态。 （二）酶具有高催化能力的原因 1. 邻近效应与定向效应 作用：使分子间的反应变成类似分子内的反应 邻近效应（proximity effect） ：中间复合物的形成使有效浓度极大升高。 定向效应（orientation effect）：正确取位。 3.电荷极化和多元催化 电荷极化——为基元催化提供了催化基团，包括广义酸碱、亲核剂、亲电剂和金属离子。 诱导契合——为基元催化创造了空间条件：把催化基团定位于底物的敏感键。 在酶促反应中经常几个催化基元配合在一起共同起作用。 多元催化提供了降低活化焓的途径，是使酶加速反应的重要因素之一。 胰凝乳蛋白酶是通过活性部位中Asp102、His57、Ser195组成的“电荷中继网”催化肽键水解，包括亲核催化和广义碱催化的协同作用。 P179 4.疏水的微环境的影响 酶的活性部位常是一个低介电区域，即疏水基团衬里或环绕的区域。 在疏水环境中底物分子与催化基团间的作用力比在极性环境中要强的多。 疏水环境大大有利于酶的催化作用。 上述加速酶促反应的诸因素，不是同时在一种酶中起作用。 不同的酶，起作用的主要因素是不一样的，每种酶都有自己的特点。 （一） 酶的别构效应和别构酶 别构效应（allosteric effect）: 很多寡聚酶，当它们的亚基上的配体结合部位与配体非共价可逆结合时，将发生构象变化并影响同一酶分子的其它亚基上的空（未被结合的）活性部位的亲和力，这一现象称为酶的别构效应，也称为别构相互作用或别构调节。 （二）协同性配体结合的模型 齐变模型 渐变模型 齐变模型 齐变模型 别构酶是由数目不多的亚基组成的寡聚蛋白质，酶分子中亚基以旋转对称方式排列，因此至少有一个对称轴。 每个亚基对每种配体至多只有一个结合部位。 每种亚基以两种不同的构象态（R态