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中国科学: 生命科学 2015 年 第45 卷 第10 期: 976 ~ 984 《中国科学 》杂志社 SCIENTIA SINICA Vitae SCIENCE CHINA PRESS 评 述 中国科学院学部 科学与技术前沿论坛 合成生物学专辑 构建合成生物学制造厂 ①②† ②† ①②③* 晁然 , 原永波 , 赵惠民 ① Department of Chemical and Biomolecular Engineering, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana IL 61801, USA; ② Carl R. Woese Institute for Genomic Biology, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana IL 61801, USA; ③ Department of Bioengineering, Department of Chemistry, Center for Biophysics and Computational Biology, University of Illinois at Urbana-Champaign, Urbana IL 61801, USA † 同等贡献 * 联系人, E-mail: zhao5@ 收稿日期: 2015-02-13; 接收日期: 2015-04-21 美国国立卫生研究院(批准号: GM077596)、美国国家科学院凯克合成生物学未来计划(批准号: NAKFI SB13)、美国国防部高级研究计划 局(批准号: HR0011-14-C-0069)、美国罗伊 J.卡弗慈善信托基金(批准号: 13-4257)和美国伊利诺伊大学基因组生物学研究所资助项目 摘要 合成生物学是一个“ 自上而下”, 以设计-构建-测试循环为研究模式、以工程化组 关键词 装构建为特征的新兴跨学科领域. 近年来在此新兴领域的众多研究成果使该研究循环获 生物制造 自动化 得了极大的成功, 特别是在基于计算机的生物系统设计、DNA 从头合成、组装及验证, 以 代谢工程 及代谢产物分析等方面为建立未来高通量生物系统加工生产线打下了坚实的基础. 本文 生物系统设计 旨在总结当前合成生物学的技术发展水平, 并对建立自动化生物产品制造厂需要应对的 DNA 组装 挑战展开讨论. DNA 测序 代谢产物分析 以正向工程方法改造不同的生物系统是科研工 基因装置或系统的能力, 使得由里及表的生物学研 作者长久以来追寻的目标, 合成生物学则是这一长 究方式成为可能. 例如, 通过搭建基因电路, 可以对 期探索的延伸. 在分子及系统生物学发展的推动下, 基因的随机表达建模, 并揭示出同基因型生物表现 合成生物学于 20 世纪 90 年代开始显现雏形[1]. 得益 型差异的机理