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遗 传 HEREDITAS (Beijing) 28(11): 1445~1450, 2006 专论与综述 DOI: 10.1360/yc-006-1445 系统发育基因组学——重建生命之树的一条迷人途径 1,2 2 于 黎 , 张亚平 (1. 云南大学生物资源保护与利用重点实验室, 昆明 650091; 2. 中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室, 昆明 650023) 摘 要: 生物基因组计划的相继启动对系统发育学研究的发展产生了深远影响。将基因组学和系统发育学结合起来 的“系统发育基因组学”在这一背景下应运而生, 这门崭新交叉学科的出现成为重建“生命之树” 的一条迷人途径。文 章重点围绕系统发育基因组学的概念以及分析方法进行扼要介绍, 并探讨了它目前潜在的问题以及将来有待发展和 完善的地方。 关键词: 系统发育学; 基因组学; 系统发育基因组学; 罕有基因组改变; 全基因组改变 中图分类号: Q111 文献标识码: A 文章编号: 0253-9772(2006)11-1445-06 Phylogenomics——An Attractive Avenue to Reconstruct “Tree of Life” YU Li1,2, ZHANG Ya-Ping2 (1. Laboratory of Conservation and Utilization of Bio-resource , Yunnan University , Kunming 650091, China ; 2. Laboratory of Molecular Evolution and Genome Diversity, Kunming Institute of Zoology , the Chinese Academy of Sciences , Kunming 650023, China) Abstract: The successive start-up of genome project in recent years has far-reaching impact on present phylogenetic studies. A new synthesized discipline ――“Phylogenomics”, combing genomics with phylogenetics together, is emerging, and becomes an attractive avenue to reconstruct “Tree of Life”. In the review, the conception and analytic method of phylogenomics are summarized. The potential problems are also suggested. Key words: phylogenetics; genomics; phylogenomics; rare genomic change (RGCs); whole-genome features (WGFs) 尽管生物界生物多种多样, 但是它们都由于一个

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