同步辐射真空紫外圆二色谱技术在DNA结构研究-上海应用物理研究所.PDF

第 33 卷 第 3 期 辐射研究与辐射工艺学报 J. Radiat. Res. Radiat. Process. Vol.33, No.3 2015 年 6 月 /fushe/CN/volumn/home.shtml June 2015 同步辐射真空紫外圆二色谱技术在 DNA 结构研究中的应用 周培培 1,2 王丽华 2 柳华杰 2 樊春海 1,2 1 （温州医科大学 温州 325035 ） 2 （中国科学院上海应用物理研究所嘉定园区 上海 201800 ） 摘要 圆二色谱(Circular dichroism,CD)技术是 DNA 结构研究的有力工具之一。目前，一般的 CD 光谱仪只 可获得 190 nm 波长以上的 CD 信号，并且在 190−220 nm 波长范围内因受到空气、溶剂、缓冲液及盐离子浓 度等的影响而噪音很大，并无太大的实用价值。同步辐射圆二色谱技术(Synchrotron radiation circular dichroism,SRCD)的发展，使得在真空紫外(Vacuum ultraviolet,VUV)区获得 DNA 结构的 CD 信号成为可能， 目前已成为研究DNA 结构的一种新的有力手段。本文首先介绍了 SRCD 技术的原理和特点，尤其是在 DNA 结构研究中的优势，然后概述了 DNA 的结构及影响 CD 信号的因素，最后以几种典型的 DNA 结构为例分析 了它们的 SRCD 特征图谱。 关键词 圆二色谱，DNA 结构，同步辐射，真空紫外 中图分类号 TL929 DOI: 10.11889/j.1000-3436.2015.rrj.33.030101 [11] 近半个世纪以来，圆二色谱(CD)技术在生物、 以上，但往往最大的吸收带处于真空紫外区域 。 化学、材料等领域取得了广泛的应用[1-7] 。同时，CD 理论模拟也指出，DNA 在 200 nm 波长以下时的 CD 技术是获得电子跃迁信息强有力的工具，适用于阐 信号带往往更强，即真空紫外区(VUV)的 CD 信号 明 DNA 的电子结构。这种光谱技术已经有效地用 更有意义。为了克服以上难题，一种有效的解决手 于化学、生物化学和结构生物学领域长达 40 a 。先 段是依赖于同步辐射(SR)光源，以提供更高的电子 进的实验装置可在 170−200 nm 的波长范围内记录 通量。 圆二色谱，但由于空气、溶剂、缓冲液、盐离子及 同步辐射光源由于具有从远红外到X 光范围内 吸收池等在真空紫外区的强烈吸收导致光子通量微 的连续光谱、高强度、高准直度、高极化度等优异 弱，这仍然是一个亟待解决的难题[8] 。同步辐射光 性能，因此与普通以氙灯为光源的光谱仪相比，具 源的发展使得真空紫外/ 紫外圆二色技术能够更加 有两个明显的优势：(1)极大地降低了噪音水平，使 方便有效地用于 DNA 结构的研究，进一步提高了 数据采集速度加快，并能探测到微弱的样品信号； 光谱的信噪比[9] 。SRCD (Synchrotron radiation cir- (2)使在广谱范围内采集信号成为可能，例如对于 cular dichroism)技术就是利用同步辐射光源来检测 CD 信号，解决了 170−200 nm 波长范围内光子通量 物质的圆二色性，相对于传统的圆二色技术(cCD)， 太低而普通 CD 光谱仪难以检测的问题。随着同步 SRCD 具有许多无法比拟的优势，