中科大 Materials Studio 培训教程4.pptVIP

* 反应物 产物 过渡态(能量鞍点) 反应势垒 反应能 反应坐标 目的: 介绍如何使用 DMol3 和 Reaction Preview 工具进行过渡态搜索的计算。 对简 单反应，这种方法是有效的。模块: Materials Visualizer, DMol3前提: 用局域内坐标对固体进行结构优化。 用LST/QST 搜索过渡态 背景 对任何反应的势能面的探索都要求知道反应进程中每一步的结构和能量，或者动力学和热动力学的快照(snapshots)。特别重要的是决定反应速率的那一步，这通常需要找到那些难以捕获的过渡态结构。有一些方法对找到过渡态的结构是很有效果的，其中比较知名的就是线性同步度越(linear synchronous transit, LST)和二次同步度越(quadratic synchronous transit,QST)。 本例中，我们将介绍DMol 中的LST /QST 工具的使用，将会看到如何使用LST/QST 搜索乙烯醇转变为乙醛的H转移反应 的过渡态结构。 CH2CHOH → CH3CHO 本例包括以下内容： ?? 1. 建立一个计算模型 ?? 2. 优化分子结构 ?? 3.定义原子对 ?? 4.用LST/QST 的方法计算过渡态 ?? 5.优化过渡态结构 1.建立一个计算模型 选择 creating