水牛ABCG2基因第9外显子群体遗传特征分析-云南农业大学学报.PDF

云南农业大学学报　ＪｏｕｒｎａｌｏｆＹｕｎｎａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，２０１２，２７（２）：１８８－１９１，１９７ ｈｔｔｐ：／／ｘｂｙｎａｕｅｄｕｃｎ ＩＳＳＮ１００４－３９０Ｘ；ＣＯＤＥＮＹＮＤＸＡＸ Ｅｍａｉｌ：ｘｂ＠ｙｎａｕｅｄｕｃｎ ＤＯＩ：１０３９６９／ｊｉｓｓｎ１００４－３９０Ｘ（ｎ）２０１２０２００９ 水牛ＡＢＣＧ２基因第９外显子群体遗传特征分析 １＃ １＃ １，２ ３ ３ １ ４ ５ 李卓然 ，李卫真 ，苗永旺 ，李大林 ，袁跃云 ，袁　峰 ，刘丽仙 ，章纯熙 （１．云南农业大学 动物科学技术学院，云南 昆明６５０２０１； ２．云南大学，云南省生物资源保护与利用重点实验室，云南 昆明６５００９１； ３．云南省家畜改良工作站，云南 昆明６５０２２５； ４．云南农业职业技术学院畜牧兽医系，云南 昆明６５０２１２； ５．中国农业科学院水牛研究所，广西 南宁５３０００１） 摘要：三磷酸腺苷结合转运蛋白Ｇ超家族成员２（ＡＢＣＧ２）对普通奶牛泌乳性状有直接影响。水牛中该基因的 遗传特征与产奶性状间是否有遗传关联目前还不十分清楚。本文采用ＰＣＲＳＳＣＰ和ＰＣＲ产物直接测序相结合 的技术，对４个河流型水牛群体和９个沼泽型水牛群体共计４６６个个体的ＡＢＣＧ２基因第９外显子进行了变异 检测。结果表明，水牛ＡＢＣＧ２基因第９外显子由２５１个核苷酸组成，所有的河流型和沼泽型水牛序列相同， 未发现ＳＮＰ位点，但在第９内含子内检测到１个Ｔ＞Ｃ替换 （ｇ．ＳＮＰ４４７６９Ｔ＞Ｃ）。与ＧｅｎＢａｎｋ数据库中已发 表的牛科物种同源序列比对后发现，数据库中一条河流型水牛序列该外显子第６６位核苷酸处有１个Ｇ＞Ａ替 换 （ｃ．ＳＮＰ１０１８Ｇ＞Ａ），导致所编码的氨基酸发生ｐ．Ｖ３４０Ｉ的改变；与普通牛、山羊和绵羊该基因第９外显 子序列的核苷酸差异位点个数分别为５，８和１１个，表明水牛与其他牛科物种间具有较大的遗传差异。本文 结果提示ＡＢＣＧ２基因第９外显子在水牛中已纯化固定，且与水牛产奶量性状间无直接关联性。 关键词：河流型水牛；沼泽型水牛；三磷酸腺苷结合转运蛋白；第９外显子；ＰＣＲＳＳＣＰ 中图分类号：Ｓ８２３８３　　文献标识码：Ａ　　文章编号：１００４－３９０Ｘ（２０１２）０２－０１８８－０５ ＰｏｐｕｌａｔｉｏｎＧｅｎｅｔｉｃＣｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＥｘｏｎ９ｏｆ ＡＢＣＧ２ＧｅｎｅｉｎＷａｔｅｒＢｕｆｆａｌｏ（Ｂｕｂａｌｕｓｂｕｂａｌｉｓ） １ １ １，２ ３ ＬＩＺｈｕｏｒａｎ，ＬＩＷｅｉｚｈｅｎ，ＭＩＡＯＹｏｎｇｗａｎｇ ，ＬＩＤａｌｉｎ， ３ １ ４ ５ ＹＵＡＮＹｕｅｙｕｎ，ＹＵＡＮＦｅｎｇ，ＬＩＵＬｉｘｉａｎ，ＺＨＡＮＧＣｈｕｎｘｉ （１．ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＡｎｉｍａｌＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ＹｕｎｎａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｋｕｎｍｉｎｇ６５０２０１，Ｃｈｉｎａ； ２．ＬａｂｏｒａｔｏｒｙｆｏｒＣｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎａｎｄＵｔｉｌｉｚａｔｉｏｎｏｆＢｉｏｒｅｓｏｕｒｃｅｓ，ＹｕｎｎａｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｋｕｎｍｉｎｇ６５００９１，Ｃｈｉｎａ； ３．ＤｏｍｅｓｔｉｃＡｎｉｍａｌＢｒｅｅｄｉｎｇａｎｄＣｒｏｓｓｂｒｅｅｄｉｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔＳｔａｔｉｏｎｏｆＹｕｎｎａｎＰｒｏｖｉｎｃｅ，Ｋｕｎｍｉｎｇ６５０２２５，Ｃｈｉｎａ； ４．ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＡｎｉｍａ