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宇佐美曲霉环氧化物水解酶基因的克隆与生物信息学分析.PDF

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宇佐美曲霉环氧化物水解酶基因的克隆与生物信息学分析

HU Die , al : g and Bioinformatics Analysis of Epoxide et Clonin Mini-Reviewni-Review 研究论文 Mi Research Article Hydrolase Gene from Aspergillus usamii 宇佐美曲霉环氧化物水解酶基因的 克隆与生物信息学分析 胡 蝶1 , 朱利娟2 , 邬敏辰*3 , 汪俊卿 1 , 唐存多1 , 冯 峰2 , 余 涛2 (1. 江南大学生物工程学院,江苏无锡214122 ; 2. 江南大学药学院,江苏无锡214122 ; 3. 江南大学无锡医学 院,江苏无锡214122 ) 摘要: 环氧化物水解酶( xide hydrolase , )是酶法拆分消旋体环氧化物,制备光学活性环氧 Epo EH 化物和邻二醇的重要酶之一。 通过RT-PCR 和新构建的THSO-PCR 侧翼未知DNA 序列扩增技 术,克隆了一种来源于宇佐美曲霉( ) 的 基因,命名为 ( Aspergillus usamii E001 EH Aueh2 GenBank No. KF061095 ),并对该基因进行了相关生物信息学分析。 Aueh2 的DNA 序列长度为2 481 bp , 其中包含了5 ′端和3′端侧翼调控序列,6 个内含子序列和编码cDNA 序列。 开放阅读框序列长 度为 1 188 bp,编码 395 个氨基酸,对应的蛋白质命名为AuEH2 ;该蛋白质为无信号肽的亲水蛋 白质,其理论相对分子质量 kD ;其三维结构包含 典型的“ ”核心催化结构域和“帽子” 44.6 EH α/ β 1 3 3 结构域,活性中心由催化三联体Asp 91 、His 69 和Glu 43 组成。 本课题研究成果为深入研究AuEH2 及其应用奠定了基础。 关键词: 宇佐美曲霉;环氧化物水解酶;侧翼未知 DNA 序列;基因克隆;生物信息学分析 中图分类号: 78 文献标志码: 文章编号: — ( ) — — Q A 1673 1689 2013 12 1244 09 Cloning and Bioinformatics Analysis of Epoxide Hydrolase Gene from Aspergillus usamii 1 2 *3 1

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