分子生物学（杨洋）第二章-染色体，染色质和核小体-chromosomes,chromatin,andthenucleosome-2014.pptVIP

Welcome to My Molecular Biology Class Chapter 2 Chromosomes, chromatin, and the nucleosome(染色体，染色质和核小体) 1. Chromosome sequence diversity（染色体序列和多样性） 1.1 Chromosomes : circular or linear（环状或线性染色体） 原核生物：大多数只有单一的环状染色体，但也有大量的原核生物含有多条染色体或者线性染色体或两者皆有 真核生物：所有真核细胞都含有多条线性染色体，2-50条 1.2 Number of Chromosomes in an organism is characteristic（每个细胞都有特定的染色体数目） 典型的原核生物细胞仅有一个完整的染色体拷贝 原核细胞中还经常携带一个或多个小的独立的环状DNA—质粒（plasmid) 质粒不是细菌生长所必需的，而是携带赋予细菌良好特性的基因（如抗生素抗性基因） 每个细胞中可以有多个完整拷贝的质粒存在 大多数真核生物细胞是二倍体（diploid),一个染色体有两个拷贝 多倍体真核细胞（polyploid): 细胞中每条染色体都超过两个拷贝 巨核细胞：特化的多倍体细胞，每条染色体有128个拷贝，通过多倍体形式维持高水平新陈代谢，以生产大量的血小板 1.3 基因组的大小与生物体复杂性相关 基因组的大小（ Genome size）：单倍染色体中DNA的长度 基因组的大小在不同生物中有相当大的变化 生物体复杂性越高，基因组越大： 原核生物基因组不足10Mb 多细胞真核生物基因组甚至可以超过10万Mb 许多复杂性相近的生物体其基因组大小却显著不同：小麦基因组是水稻基因组的40倍 基因的数目而不是基因组的大小与生物体的复杂性更密切相关 Gene number（基因数目）: the number of genes included in a genome Gene density（基因密度）: the average number of genes per Mb of genomic DNA 什么原因导致基因密度的减小？ Increases in gene size（基因长度的增加的两个原因）: (1) increase in the sequence of regulatory sequence（当生物体复杂性增加时，基因的调控序列的长度显著增长） (2) presence of introns (内含子，真核生物中编码蛋白质的基因通常是不连续的，非蛋白质编码区段—内含子) 在更复杂的生物中基因间隔区序列数目的大量增加是导致基因密度降低的另一个重要原因 基因间隔区（ intergenic sequences） ：基因组上与蛋白质和结构RNA的表达无关的那部分DNA 人的基因组中有超过60%的部分由基因间隔区序列组成，绝大多数功能未知 基因间隔区分为两类： (1) unique（唯一的） (2) repeated（重复的） 3. The nucleosome （核小体） DNA通过包装进核小体，被压缩了6倍，远不及真核细胞中观察到的压缩1000-10000倍的DNA 但是这种DNA的初始包装对于后续的DNA压缩是至关重要的 在任何细胞中都会有数段DNA没有被包装到核小体中 这些DNA区段一般参与基因的表达，复制或重组 这些位点尽管未与核小体结合，但通常与参与调控或参与这些过程的非组蛋白结合 组蛋白与带负电荷的DNA分子紧密结合，组蛋白中带正电荷的氨基酸含量很高 各种组蛋白中有超过20%的氨基酸是赖氨酸或精氨酸 核心组蛋白是相对较小的蛋白质，分子量：11-15 kd。而组蛋白H1的分子量约为20 kd 核小体的蛋白核是一个圆盘状结构，只有当DNA存在时才组装成一个有序的结构 无DNA时，核心组蛋白在溶液中形成中间组装体 The core histones share a common structural fold, called histone-fold domain (组蛋白折叠结构域） --在每种核心组蛋白中都存在一个保守区域，称为组蛋白折叠结构域，调节这些组蛋白中间体的组装 组蛋白H3和H4首先形成异源二聚体，然后两个二 聚体形成一个四聚体，含有2个分子的H3和H4 H2A和H2B在溶液中形成异源二聚体而不是四聚体 每个核心组蛋白有一个N端延伸，称为“尾巴”（TAIL），是完整核小体中易接近的部分 用胰蛋白酶处理核小体能够检测到这种易接近性 用胰蛋白酶处理核小体能够迅速地去除组蛋白易接近的N端尾巴，但不能切断紧密包装的组