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后基因组时代的流感病毒研究 —疾控视角的病毒学 祁 贤 副研究员 江苏省CDC急性传染病防制所 2013-2-28 Jiangsu Provincial Center for Disease Prevention and Control 一、流感基因组测序计划 二、基于（流感）病毒基因组的相关研究 Jiangsu Provincial Center for Disease Prevention and Control 一、流感基因组测序计划 Jiangsu Provincial Center for Disease Prevention and Control 人类基因组计划（Human Genome Project，HGP）  1990-2003完成，36.1亿bp， 2-3万个基因  2008年提出1000 Genomes Project Jiangsu Provincial Center for Disease Prevention and Control 微生物基因组计划(Microbial genome project，MGP)  1994年美国能源部提出，主要是非致病微生物，尤其是 与环境、系统发育、商业或能源相关的微生物。  病原微生物基因组测序：主要由美国NIH下属的National Institute of Allergy and Infectious Disease and Human Pathogens （NIAID）资助。 Jiangsu Provincial Center for Disease Prevention and Control 流感基因组测序计划（Influenza Genome Sequencing Project，IGSP）  研究背景： NIH下属的NIAID资助下，主要在The Institute for Genomic Research (TIGR) 进行.从2005年开始，完成 4,000流感 病毒全基因组，包括人、猪、禽流感毒株， 亚型包括H1,H3,H5等，所有序列都提供到 GenBank，供全球免费共享。 所有这些信息的获取，不  意义： 仅有助于减轻每年季节性 流感造成的影响，同时也 1.为全球流感研究者在疫苗、治疗药 为大流行病毒的监测和发 物和诊断技术等研究方面提供必要的信息。 现提供重要的信息。 2. 有助于更好地全面了解流感的分子 进化，发现病毒毒力的遗传因子。 Jiangsu Provincial Center for Disease Prevention and Control 甲型流感病毒特点  甲型流感病毒的基因组 由8个独立的RNA片段组 成，约13000bp,编码12 种蛋白  RNA为单股负链  血清学型众多，宿主范 围广  变异频繁 甲型流感病毒结构示意图（McHardy AC and B Adams,PLoS pathogens,2009,5(10):e1000566） Jiangsu Provincial Center for Disease Prevention and Control 甲型流感病毒编码蛋白 蛋白分类