2019年医学信息标准化.ppt

作用 ICD介绍(ICD基本知识 与 具体应用) SNOMED 介绍(基本知识 与 具体应用) GO介绍(基本知识 与 具体应用) UMLS介绍(基本知识 与 具体应用) DICOM介绍(基本知识 与 具体应用) HL7介绍(基本知识 与 具体应用) MeSH RxNorm 生物信息资源 UniProt Medline ICD的应用和意义 ⑴标准化：医学信息化的基础 ⑵共享性：疾病信息得到最大范围的共享 ⑶有利医疗管理：医疗统计的基础 ⑷有利费用管理：医疗经费控制的重要 依据之一 2人类与兽类医学系统术语SNOMED 概述 用于人、兽医学的结构化术语集和术语的分类 第一版发布于1975年 《人类与兽类医学系统术语》 也称《国际医学规范术语全集》 第三版（SNOMED INTERNATIONAL） SNOMED的结构 索引排列是按照编码顺序 T-00000 皮肤系统 T-01000 皮肤 T-01200 真皮 T-01220 真皮乳头 T-01221 网状真皮 SNOMED 是当前国际上广为使用的一种临床医学术语标准，涵盖大多数方面的临床信息，如疾病、所见、操作、微生物、药物等，可以协调一致地在不同的学科、专业和照护地点之间实现对于临床数据的标引、存储、检索和聚合，便于计算机处理。包含词量为1166529条。 SNOMED的应用 ◇将人、兽医学术语进行结构化的分类和编码，使得原有的医学术语标准化，为计算机处理奠定了基础 ◇ 有利于医学信息共享和提高医疗质量 ◇ 术语代码拥有医学知识表达的许多特征 　　　具开放式的数据结构 　　　可灵活地进行搭配、组装、合成 　适用于电子病历，并支持专家系统 基因本体GO 美国基因本体协会创建与维护的基因本体GO（gene ontology）在生物信息学领域中广泛使用的本体，用于创建共享的生物信息资源，允许业界利用公共词汇和语义描述基因产品，提供在不同数据库中的基因产品的一致性描述。 基因本体GO GO主要包括三大独立的本体: 生物过程（biological process）、分子功能（molecular function）和细胞组件（cellular component）。 基因本体GO Gene Ontology是一个使用有控制的词汇表和严格定义的概念关系。 在基因表达谱分析中，GO常用于提供基因功能分类标签和基因功能研究的背景知识。利用GO的知识体系和结构特点，旨在发掘与基因差异表达现象关联的单个特征基因功能类或多个特征功能类的组合。 基因本体GO GO的思想大概如下：对于一个基因产品（蛋白质或RNA），用某些词汇来描述它是干什么的或位于细胞哪里、或者参与了哪个生物过程，而这些词汇就是来自GO的Term。 Term是GO里面的基本描述单元 结构如下： Accession： GO:0005515 Ontology： molecular function Synonyms： related: alpha-2 macroglobulin receptor-associated protein activity related: protein degradation tagging activity related: protein tagging activity exact: protein amino acid binding alt_id: GO:0045308 Definition： Interacting selectively with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). [source: GOC:go_curators] Comment： None Subset： UMLS UMLS (Unified Medical Language System)是美国国家医学图书馆建立的关于生物医学和健康的知识组织体系。 UMLS UMLS共有三个知识源数据库，它们是Metathesaurus、语义网络（Semantic Network）和专家词典（SPECIALIST lexicon）。UMLS知识源数据库被设计为多种用途，能用于多种类型的信息系统，如病例、科学文献、索引和公共健康数据。 UMLS Metathesaurus是一个非常大的、多用