R语言自动化报告格式——knitr[1].PDFVIP

R语言自动化报告格式——knitr[1] 一、背景2 1、文学化编程也是编程2 2、Markdown 是什么，如何写 Markdown[]3 二、创建knitr文档4 三、相关代码——文本输出[]5 [1] knitr官网 /knitr/在官网中有谢益辉自己录制的一段英文的讲解视频 R语言自动化报告格式——knitr 一、背景 在 R的世界里 ，凡是提到自动化报告 ，很多人就会想到Sweave ，它已经诞生十几年了。 它的主要设计思想来自于文学化编程 （LiterateProgramming），这是 Knuth大神提出来 的一种编程范式，它与传统的结构化编程不同。 knitr(发音为 ：nit-ter)是由纯文本 (就像你正在阅读的) 和 R代码交织在一起的文档文 件. 用作者的话来说就是 ：“knitr 是一头灵活 ，快速的大象!” 你可能正在想……这玩意和 数据挖掘有什么必然的关系呢？ 使用 knitr去学习数据挖掘乍看起来是一个奇怪的搭配， 但确实是一条很好的学习途径。 有三个方面的原因: 这是学习 R完美的途径。不一定每个人都是这样做的，但是knitr 能让你运用学到的东西以及建立一个可重复生成报告的文件。 Knitr和 RStudio集成是快 速生成报告的最佳组合。简单地说，报告中有文字也有代码，Knitr就是通过 markdown 的语法在报告中该显示代码的地方显示代码 ，该显示运行结果（比如图表）的地方显示运行 结果 ，这样整个报告文档就可以直接运行再次生成报告 ，而不需要把代码单独复制到控制台 中执行，然后再把执行结果添加到文档中。 1、文学化编程也是编程 文学化编程（LiterateProgramming）是整个设计的核心思想，但过去的模式局限在 “代码+文档”的简单模型上，knitr使得一份文档变得可编程。 [2] 2、Markdown 是什么，如何写 Markdown[3] Markdown 是一种轻量级标记语言。类似 HTML，但是比html简单的多，我在文件 夹中放了一个markdown的语法说明。 大家具体可以用一段时间学会。我们这里知道这 么几点就可以了。标题，一个#后面跟一个空格代表一级标题，2个## 后面跟一个空格 表二级标题。 1. howareyou斜体 2. howareyou加粗 [2] knitr与可重复的统计研究（花絮 篇） /2012/06/reproducible-research-with-knitr/ [3] /art/2373113 二、创建knitr文档 不要停下来!通过以下 5步，你就可以创建自己的第一个knitr文档：  打开 RStudio, 点击 File New File R Markdown…创建一个新的 R Markdown 文件  为这个文件起一个有意义的名字。  点击OK.  删除第二个之后出现的文字  点击 KnitHTML.  你的 RMarkdown代码应该像下面这样： title: YourTitle output: html_document 在 “knitting”你的文件后, 你应该会在查看器窗格看到下面的文字: 恭喜你! 你已经成功创建了第一个 knitr文件! 三、相关代码——文本输出[4] 在文本输出方面，knitr包支持以下功能：  代码高亮（highlight=TRUE），增强可读性 ，有无数的高亮主题可选 ，仅适用于 LaTeX 和 HTML输出，MD文档在转为HTML文档之后可以用专门的JavaScript库去高亮代码  代码重排（tidy=TRUE ），对那些不注意代码格式的人来说很有用，再乱的代码，到 了这里也会变得相对整齐，本功能由formatR包支持  执行或不执行代码（eval=TRUE/FALSE），不执行的代码段将被跳过，原样输出源 码  显示/隐藏源代码（echo=TRUE/FALSE），甚至精确控制显示哪几段代码（echo取数 值）  显示/隐藏普通文本输出或将文本输出以原样形式输出（results=markup, hide, asis）  显示/隐藏警告文本（warning=TRUE/FALSE ）、错误消息（error ）和普通消息 [4] 谢益辉《自动化报告》/yihui/r-ninja/blob/master/11-auto-repo