贾第虫sRNA的鉴定、结构与功能研究-生物化学与分子生物学专业论文.docxVIP

贾第虫sRNA的鉴定、结构与功能研究缩略词 贾第虫sRNA的鉴定、结构与功能研究 缩略词 amp ampicillin 氨苄青霉素 AP Ammonium persulfate 过硫酸铵 bis N．N-methylenebisacrylamide N，N’．亚甲叉双丙烯酰胺 bp base pair 碱基对 DNA deoxyribonucleic acid 脱氧核糖核酸 cDNA complementary DNA 互补DNA rDNA ribosomal DNA 核糖体DNA DEPC diethvl pyrocarbonate 焦碳酸二乙酯 DMSO dimethyl sulfoxide 二甲基亚砜 dNTP deoxyribonucleoside triphosphate 脱氧核糖核苷三磷酸 DTT dithiothreitol 二硫苏糖醇 EDTA ethvlene diaminetetraacetic acid 乙二胺四乙酸 pg microgram 微克 IPTG isopropylthio-13--D·-galactoside 异丙基硫代．B—D．半乳糖 苷 kb kilo bases 干碱基 mol molar 摩尔 mI mililiter 毫升 nt nucleotide 核苷酸 ORF open reading frame 丌放读码框 PCR polymerase chain reaction 聚合酶链式反应 Ⅵ pseudouridine 假尿嘧啶 RNA ribonucleic acid 核糖核酸 rRNA ribosomaI RNA 核糖体RNA tRNA transfer RNA 转运RNA RNuse ribonuclease 核糖核酸酶 RNP ribonucleoprotein particles 核糖核蛋白体颗粒 SIIORNP small nucleolar RNP 核仁小分子RNA核蛋白 体颗粒 S Sevdberg unit Sevdberg单位 SDS sodium dodecyl sulfate 十二烷基硫酸钠 TEMED N，N，N’，N’一tetramethy’le thylenediamine N．N，N’，N’一四甲基乙二胺 TMG trimethyl guanosine 三甲基鸟嘌呤 1tis tris(hydroxymethyl)- 三(羟甲基)氨基甲烷 Aminomethane X-gal 5·bromo一4一chloro．．3一 indolyl·B·D-galactose 5’．溴．4．氯．3．吲哚 一p—D-半乳糖苷 肛I Mierolker 微升 杨承勇 杨承勇 中山大学博士学位论文 摘要 真核生物中拥有大量的非信使小RNA(small non-messenger RNA， snmRNA)，它们在基因表达调控中发挥着多种作用。其中核仁小分子RNA (snoRNA)是细胞中snmRNA的重要组成部分，根据其结构特征主要包括两类： boxC／D snoRNA和boxH／ACA snoRNA。自二十世纪90年代以来，在不同的真 核生物以及古细菌中发现大量的snoRNA，对它们的结构、功能、基因组织和基 因表达的研究难不断深入。近来，在一些原始真核生物，包括薄肌眼虫(E． gracilis)和锥虫(Z brucei)中鉴定了大量snoRNA，并发现这些原始真核生物 中snoRNA具有一些特点，如以基因簇为主的基因组织，box C／D snoRNA中双 功能的分予较多，另外boxH／ACA snoRNA全部是单环结构。由于单环也是古细 菌boxH／ACA sRNA的结构特点，因此认为单环代表了原始boxH／ACARNA的 分子结构。然而，目前关于原始真核生物snoPaNA的研究还只限于少数几种生物， 并不能得到足够的信息以全面认识早期真核生物中的snoRNA。贾第虫(Giardia lamblia)是一种原始的真核生物，系统学研究表明它的分化位于真核生物进化树 的最底部。但是和其它真核生物不同的是，它没有核仁，并具有一些原核生物的 特征。在某些方面，贾第虫被认为是原核生物和真核生物之间的一个过渡，因此 是研究真核细胞形成的理想模式生物。最近，一种在真核生物中和box C／D snoRNA结合并在rRNA前体加工中起重要作用的蛋白一一核仁纤维蛋白 (fibrillarin)，在贾第虫中被发现，它和3种贾第虫小分子RNA的相互作用得到 研究。比较其它真核生物中snoRNA的数量，推测贾第虫中尚有许多snoRNA有 待发现和鉴定。对贾第虫中小分子RNA(sRNA)的系统鉴定，将会提供大量有 关原始真核生物snoRNA同源分子的信息，有利于了解snoRNA基因从原