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(五)四级缔合在结构和功能上的优越性 1.增强结构稳定 2.提高遗传经济性和效果 3.使催化基团汇集在一起 4.具有协同性和别构效应 人有了知识,就会具备各种分析能力, 明辨是非的能力。 所以我们要勤恳读书,广泛阅读, 古人说“书中自有黄金屋。 ”通过阅读科技书籍,我们能丰富知识, 培养逻辑思维能力; 通过阅读文学作品,我们能提高文学鉴赏水平, 培养文学情趣; 通过阅读报刊,我们能增长见识,扩大自己的知识面。 有许多书籍还能培养我们的道德情操, 给我们巨大的精神力量, 鼓舞我们前进。 * (二)结构域 在二级结构及超二级结构的基础上,多肽链进一步卷曲折叠,组装成几个相对独立、近似球形的三维实体。结构域是球状蛋白的折叠单位,多肽链折叠的最后一步是结构域间的缔合。 现在,结构域的概念有三种不同而又相互联系的涵义:即独立的结构单位、独立的功能单位和独立的折叠单位。 类型: α -螺旋域; β -折叠域; α+β域; α /β域;无规则卷曲+β-回折域;无规则卷曲+ α -螺旋结构域 对于较小的蛋白质分子或亚基来说,结构域和三级结构往往是一个意思,就是说这些蛋白质是单结构域的。 每个结构域承担一定的生物学功能,几个结构域协同作用,可体现出蛋白质的总体功能。 七、球状蛋白质与三级结构 三级结构( tertiary structure )是指球状蛋白质的多肽链在二级结构的基础上,通过侧链基团的相互作用进一步卷曲折叠,借助次级键维系使α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲等二级结构相互配置而形成特定的构象。三级结构的形成使肽链中所有的原子都达到空间上的重新排布。 1.全α结构蛋白质 (一)球状蛋白质的分类 蚯蚓血红蛋白中四个?-螺旋组成的结构域 两个铁原子 α螺旋占极大优势的结构。最简单的是反平行螺旋束,螺旋疏水面朝向内部、亲水面朝向溶剂。 另一亚类是珠蛋白型α螺旋蛋白,一级结构上相邻的两个螺旋采取相互垂直的取向。 肌红蛋白 2.α、β-结构(平行或混合型β折叠片)蛋白质 平行β折叠片一般存在于蛋白质的核心结构。 α、β-结构可分为两类: (1)单绕平行β桶:由8个平行β折叠股环形排列,在第1和第8两个折叠股之间借氢键键合形成一个闭合式圆桶。这种结构由肽链按Rossman折叠方式单向卷曲而成(内桶)。 7个α螺旋和C-末端的一个α螺旋组成与内桶平行的外桶。 内、外两桶的疏水夹心层构成疏水核心。 (2)双绕平行β片:中间由4~9个平行的β折叠股或混合型的β折叠股构成的开放β片(马鞍型扭曲片)。其两侧由α螺旋和环状区段保护。 肽链从折叠片中开始向一个方向卷绕形成Rossman折叠,α螺旋覆盖在折叠片的一侧,然后改变方向回到折叠片的中部向相反方向卷绕再形成Rossman折叠,α螺旋覆盖在折叠片的另一侧。 乳酸脱氢酶结构域1 双绕平行β片蛋白是3个主链结构层和两个疏水区,而单绕平行β桶是4个主链层和3个疏水区。 顶面 侧面 (3)全β-结构(反平行β折叠片)蛋白质: 反平行β折叠片一般把疏水残基安排在折叠片的一侧,亲水残基在另一侧。至少有两个主链结构层:两层β折叠片或一层β折叠片和一层α螺旋。两个β折叠片的疏水面对合形成疏水区,相背的两面暴露于溶剂。分为两个主要类型:反平行β桶和反平行β片。 免疫球蛋白VL β -折叠结构域 the Barrel of Rhodobacter Capsulatus (4)富含金属或二硫键蛋白质 金属形成的配体或二硫键对蛋白质构象起稳定作用。 (二)球状蛋白质三维结构的特征 ?含多种二级结构单元; ?有明显的折叠层次; ?是紧密的球状或椭球状实体; ?分子表面有一空穴(活性部位); ?疏水侧链埋藏在分子内部,亲水侧链暴露在分子表面。 β-折叠 β-转角 无规则卷曲 空穴 α-螺旋 八、膜蛋白的结构 大多数膜蛋白可分为膜周边蛋白和膜内在蛋白。膜周边蛋白主要通过膜内在蛋白的静电相互作用和氢键键合相互作用与膜结合。膜内在蛋白与脂双层强缔合,有的一部分或大部分埋入脂双层,有的横跨脂双层。 还有一类称为脂锚定蛋白质,通过各种共价连接的脂锚钩与膜缔合。 (一)膜内在蛋白 脂双层疏水核心内的膜内在蛋白结构主要由α螺旋或β折叠片构成。 1.具有单个跨膜肽段的膜蛋白 跨膜的疏水肽段经常是一个α螺旋棒。 血型糖蛋白。 2.具有多个跨膜肽段的膜蛋白 一条多肽链来回跨膜折叠,形成一个由多个经常是7个α螺旋段反平行装配的球状膜蛋白。 3.β桶形膜蛋白——膜孔蛋白 亲水侧链面向桶中央孔道或空腔,疏水侧链分布在桶的外侧,在这里与膜的疏水脂烃链相互作用。 The human beta barrel porin protein (二)脂锚定膜蛋白 某些膜蛋白与脂分子共价连接,脂质部分可插入脂双层中,有效地把被连接的蛋白质锚定在
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