分子动力学模拟在药物与膜相互作用研究中的应用-Journalof.PDF

第43卷 第12期 北 京 工 业 大 学 学 报 Vol.43 No.12 2017年 12月 JOURNAL OF BEIJING UNIVERSITY OFTECHNOLOGY Dec. 2017 分子动力学模拟在药物与膜相互作用研究中的应用 1 2 3 3 3 4 3 陈摇 舟 ,任摇 丁 ,朴莲花 ,许晓双 ,常摇 珊 ,刘继勇 ,孔摇 韧 (1.江苏理工学院化学与环境工程学院,江苏 常州摇 213001;2.解放军八五医院,上海摇 200052; 3.江苏理工学院电气信息工程学院生物信息与医药工程研究所,江苏 常州摇 213001; 4.第二军医大学长海医院药学部,上海摇 200433) 摘摇 要:药物与细胞膜的相互作用是决定药物在体内吸收、分布、代谢与排泄的关键因素之一,最终影响临床上的 药效与毒副作用. 对药物透膜过程的分子动力学模拟可在原子层面上提供药物与膜相互作用的丰富信息,从而指 导药物分子的设计与优化以及载药体系如脂质粒的优化. 从磷脂双分子层模型、全原子/ 联合原子模型方法及粗粒 化模型方法、膜性质关键参数分析等方面展开介绍,并对系列药物分子与膜的相互作用分子动力学模拟应用实例 进行了综述. 关键词:药物与膜相互作用;分子动力学模拟;磷脂双分子层 中图分类号:O641 文献标志码:A 文章编号:0254-0037(2017)12-1802-09 doi:10.11936/ bjutxb2017090004 Application of Molecular Dynamics Simulations to Study Drug鄄Membrane Interactions 1 2 3 3 3 4 3 CHEN Zhou ,REN Ding ,PIAO Lianhua ,XU Xiaoshuang ,CHANG Shan ,LIUJiyong ,KONG Ren (1.School of Chemical and Environmental Engineering,Jiangsu University of Technology,Changzhou213001,Jiangsu,China; 2.PLA 85th Hospital,Shanghai200052,China;3.Institute of Bioinformatics and Medical Engineering, School of Electrical and Information Engineering,Jiangsu University of Technology,Changzhou213001,Jiangsu,China; 4.Department of Pharmacy,Changhai Hospital,the Second Military Medical University,Shanghai200433,China) Abstract:The interactions between drugs and bio鄄membranes play a key role in the in vivo behavior of drugs such as absorption,distribution,metabolism and elimination. Thus the clinical outcomes of drugs including both efficacy and side eff