2019年PERL在生物信息学中的应用.pptVIP

PERL在生物信息学中的应用 主讲：吴茂英 生物信息学与生物统计学系 上海交通大学 主要内容 PERL简介 PERL脚本的编写 PERL变量 Perl语法 PERL与正则表达式 PERL示例 PERL释义 Perl的环境准备 Perl的工具 Perl的功能 Perl的应用 Web编程：CGI，XML处理 系统管理 网络编程（安全脚本）. 数据库管理 图像处理 其他众多的领域。。。 一个示例 #!/usr/bin/perl Print “This is my first perl program\n”; $a=; Print $a; perl的四种变量 Scalar：标量，以$开始，后面以字母或_开头，再后面可以是字母或数字 array：数组，列表，以＠开头 Hash： 哈希，散列，以%开头 文件：大写字母 区分大小写，$Var, $VAR, $var 内置变量$/，$@等 字符串变量 由双引号或单引号标识的一组字符组成。 最少0个字符（“”为空串），最多可以占满内存，末尾不含null(‘\0’) “${str}ing” = $str + “ing” != $string 记住一些常用的转义字符 print “the \$var is $var.” 注意单引号的用法：不替换、不转义 变量初值 未创建时状态为undef，到达文件尾也为undef 说明变量为未定义：undef $a;