微生物组学中的高维计数和成分数据分析.PDFVIP

中国科学 数学 年 第 卷 第 期 综 述 微生物组学中的高维计数和成分数据分析 献给钱敏教授 华诞 1 1 1,2,3 ∗ 吴昌晶 何顺 邓明华 1. 北京大学数学科学学院, 北京 100871; 2. 北京大学定量生物学中心, 北京 100871; 3. 北京大学统计科学中心, 北京 100871 E-mail: wcj@, heshun@, dengmh@ 收稿日期: 2017-07-03; 接受日期: 2017-09-29; 网络出版日期: 2017-11-16; * 通信作者 国家重大科学研究计划(批准号: 2015CB910303)、国家重点研发计划 (批准号: 2016YFA0502303) 和国家自然科学基金 (批准号: 资助项目 摘要 人体微生物组对人体健康和疾病起着重要作用 高通量测序技术的发展使得我们可以定量分析 微生物组中所有菌种的成分 本文回顾近来在微生物组学研究中的高维计数和成分数据分析方法 其 中包括 多项分布模型及其拓展、从大维稀疏计数矩阵估计成分数据、高维成分回归和基于 对数基底的成分数据统计推断方法 关键词 高维计数数据 成分数据 多项分布模型 稀疏性 可识别性