基于GEO数据库的HPV阳性口咽癌特征基因生物-中国现代应用药学.PDFVIP

基于 GEO 数据库的 HPV 阳性口咽癌特征基因生物信息学研究  1,2 1 3 1 1 1,2* 张轶雯 ，钟里科 ，楼倩雯 ，潘宗富 ，方罗 ，黄萍 (1.浙江省肿瘤医院药剂科，杭州 310022 ；2.浙江省头颈肿瘤转 化医学研究重点实验室，杭州 310022 ；3.浙江大学城市学院药学院，杭州 310001) 摘要：目的 通过分析HPV 阳性与阴性口咽癌患者基因芯片数据，寻找差异基因及其关键通路，区分不同HPV 感染状 态下口咽癌的分子表达特征基因谱。方法 利用GEO 数据库中高通量基因芯片数据库筛选出口咽癌患者具有HPV 感染 状态信息的芯片。采用GO 基因功能注释和KEGG 通路富集分析，筛选出可表征不同HPV 感染状态口咽癌生物特性的特 征基因簇和通路，并进行蛋白质相互作用网络可视化分析。结果 经差异基因分析后，发现HPV 感染状态可影响口咽癌 的生物学特征，并显著改变一些重要的肿瘤信号通路，如Wnt 信号通路和PI3K-Akt 信号通路等。结论