微卫星多态性和多位点序列分析技术在光滑念珠菌基因分型-检验医学.PDF

检验医学２０１４年６月第２９卷第６期　ＬａｂｏｒａｔｏｒｙＭｅｄｉｃｉｎｅ，Ｊｕｎｅ２０１４，Ｖｏｌ２９．Ｎｏ６． ·５９３· 文章编号：１６７３８６４０（２０１４）０６０５９３０４　　中图分类号：Ｒ４４６．５　　文献标志码：Ａ　　ＤＯＩ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１６７３８６４０．２０１４．０６．００４ 微卫星多态性和多位点序列分析技术 在光滑念珠菌基因分型中的应用评估 姚冬婷，　应春妹，　郑　冰 （上海交通大学医学院附属仁济医院检验科，上海２００１２７） 　　摘要：目的　评估微卫星多态性分析技术在临床光滑念珠菌基因分型中的作用。方法　收集２０１１年１月 至２０１２年１２月仁济医院和东方医院临床分离的光滑念珠菌５９株，采用多位点序列分析（ＭＬＳＴ）和微卫星多态 性分析技术进行基因分型，比较２种基因分型方法的结果和分辨力。结果　５９株光滑念珠菌经ＭＬＳＴ分型得到 ６个序列型，其中ＳＴ７型４３株、ＳＴ１０型７株、ＳＴ１５型和ＳＴ５５型各３株、ＳＴ３型２株、ＳＴ４３型１株，鉴别力指 数（ＤＰ）为０．４５６；经微卫星多态性分析方法分为１０型，其中Ａ型２５株、Ｂ型１０株、Ｃ型８株、Ｄ型６株、Ｅ型３ 株、Ｆ型和Ｇ型各２株、Ｈ～Ｊ型各 １株，ＤＰ为０．７７０。结论　微卫星多态性分析方法简便、快速，分辨力高于 ＭＬＳＴ技术，可作为实验室基因分型的首选方法。 关键词：光滑念珠菌；基因分型；多位点序列分析；微卫星多态性分析 　　Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｅｖａｌｕａｔｉｏｎｏｆｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ａｎｄｍｕｌｔｉｌｏｃｕｓｓｅｑｕｅｎｃｅｔｙｐｉｎｇｉｎｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇｏｆ Ｃａｎｄｉｄａｇｌａｂｒａｔａ　ＹＡＯＤｏｎｇｔｉｎｇ，ＹＩＮＧＣｈｕｎｍｅｉ，ＺＨＥＮＧＢｉｎｇ．　 （ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＣｌｉｎｉｃａｌＬａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｒｅｎｊｉ Ｈｏｓｐｉｔａｌ，ＳｈａｎｇｈａｉＪｉａｏｔｏｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＳｃｈｏｏｌｏｆＭｅｄｉｃｉｎｅ，Ｓｈａｎｇｈａｉ２００１２７，Ｃｈｉｎａ） 　　Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ　Ｔｏｅｖａｌｕａｔｅｔｈｅａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｃｅｏｆｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｉｎｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇｏｆ Ｃａｎｄｉｄａｇｌａｂｒａｔａ．Ｍｅｔｈｏｄｓ　ＦｒｏｍＪａｎｕａｒｙ２０１１ｔｏＤｅｃｅｍｂｅｒ２０１２，５９ｉｓｏｌａｔｅｓｏｆＣａｎｄｉｄａｇｌａｂｒａｔａｗｅｒｅｃｏｌｌｅｃｔｅｄ ｆｒｏｍＲｅｎｊｉＨｏｓｐｉｔａｌａｎｄＥａｓｔＨｏｓｐｉｔａｌ．Ａｌｌｔｈｅ５９ｉｓｏｌａｔｅｓｗｅｒｅｔｙｐｅｄｂｙｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍａｎｄｍｕｌｔｉｌｏｃｕｓ ｓｅｑｕｅｎｃｅｔｙｐｉｎｇ（ＭＬＳＴ）．Ｔｈｅｒｅｓｕｌｔｓａｎｄｄｉｓｃｒｉｍｉｎａｔｉｏｎｏｆｔｈｅ２ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇｍｅｔｈｏｄｓｗｅｒｅｃｏｍｐａｒｅｄ．Ｒｅｓｕｌｔｓ　Ｂｙ ＭＬＳＴ，ｔｈｅ５９ｉｓｏｌａｔｅｓｂｅｌｏｎｇｅｄｔｏ６ｃｌｏｎｅｓｅｑｕｅｎｃｅｓ，ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ４３ｉｓｏｌａｔｅｓｗｉｔｈＳＴ７，７ｉｓｏｌａｔｅｓｗｉｔｈＳＴ１０，３ｉｓｏｌａｔｅｓ ｗｉｔｈＳＴ１５，３ｉｓｏｌａｔｅｓｗｉｔｈＳＴ５５，２ｉｓｏｌａｔｅｓｗｉｔｈＳＴ３ａｎｄ１ｉｓｏｌａｔｅｗｉｔｈＳＴ４３，ａｎｄｔｈｅｉｎｄｅｘｏｆｄｉｓｃｒｉｍｉｎａｔｏｒｙｐｏｗｅｒ （ＤＰ）ｗａｓ０．４５６．Ｂｙｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ，ｔｈｅ５９ｉｓｏｌａｔｅｓｗｅｒｅｃｌａｓｓｉｆｉｅｄｉｎｔｏ１０ｇｅｎｏｔｙｐｅｓ．Ｔｈｅｒｅｗｅｒｅ２５ ｉｓｏｌａｔｅｓｗｉｔｈｔｙｐｅＡ，１０ｉｓｏｌａｔｅｓｗｉｔｈｔｙｐｅＢ，８ｉｓｏｌａｔｅｓｗｉｔｈｔｙｐｅＣ，６ｉｓｏｌａｔｅｓｗｉｔｈｔｙｐｅＤ，３ｉｓｏｌａｔｅｓｗｉｔｈｔｙｐｅＥ，２ ｉｓｏｌａｔｅｓｗｉｔｈｔｙｐｅＦ，２ｉｓｏｌａｔｅｓｗｉｔｈｔｙｐｅＧ，１ｉｓｏｌａｔｅｗｉｔｈｔｙｐｅＨ，１ｉｓｏｌａｔｅｗｉｔｈｔｙｐｅＩａｎｄ１ｉｓｏｌａｔｅｗｉｔｈｔｙｐｅＪ，ａｎｄｔｈｅ