蛋白质结构相关.ppt

* * 东南大学 吴健雄实验室 1、基因组DNA的奥秘 遗传信息存贮在4种字符组成的核酸序列中 “天书”——用遗传语言书写的人类遗传蓝本 包含的信息量巨大 更重要的是目前人类对它了解甚少 天书中只有4个字符（碱基A、T、G、C） 既没有段落，也没有标点符号 是一个长度为3×109的一维序列。 科学家对这本天书了解最多的部分就是遗传密码 或者说掌握了DNA对蛋白质编码的规律 关于密码子 （1）密码子的使用是非随机的 如果密码子的第一、第二位碱基是A、U， 那么第三位将尽可能使用G、C；反之亦然。 如果三位都用G、C，则配对容易，分解难； 三位都用A、U，则相反。 一般地说，高表达的基因，要求翻译速度快， 要求密码子和反密码子配对快、分手也快。 （2）密码子的使用有一定的统计规律 对同义密码子的使用存在着偏爱 不同种属偏爱的密码子不同 人类基因组： 密码子第三位取A、U的情况占90% 而第三位取G、C仅占10% 密码子的使用偏性与基因功能、蛋白质结构相关 （3）密码子中的密码 三个碱基的位置与所编码的氨基酸性质存在着联系 例如： 芳香族氨基酸——以U作为第一位碱基 中间位置碱基的性质与氨基酸是亲疏水性相关 疏水氨基酸的密码子，其第二位碱基是U 亲水氨基酸的密码子，其第二位碱基是A 第二位碱基是G、C的密码子所编码的氨基酸亲水性、疏水性居中。 基因组信息 人类基因组： 编码区域只占1%-3% 对于非编码序列，尚不清楚其含义或功能 非编码区域对于生命活动具有重要的意义 包括内含子、简单重复序列、移动元件、伪基因 重复序列: 卫星（satellite）DNA 小卫星（mini-satellite）DNA 微卫星（micro-satellite） 顺式调控元件: 启动子、增强子、沉默子 2、探索遗传语言 用语言学的方法进行研究 自然语言 计算机程序设计语言 遗传语言 二进制序列0、1的长程关联性分析结果： 编码区域 ——自然语言 非编码区域 —— 程序设计语言 蛋白质编码区域所包含的信息相当于待加工的“数据” 数据经过加工处理以后产生对应的蛋白质； 而非编码区域则相当于“程序”或“指令”，确定如何在时间和空间方面控制基因的表达和蛋白质的合成 用密码学方法进行研究 是否存在其它密码？ ——调控信息密码？ ——蛋白质结构的密码？ 编码在DNA上的一维程序如何在四维时空中控制生命体的生长发育 3、关于生物复杂性 生物的复杂性不仅仅是基因的数目 人类基因约为30000个 线虫有20000个基因 230000/220000=210000≌103000 4、基因组计划带来的希望 实验数据的积累速度在迅速地增加 计算机科学和技术也在不断地发展 单个基因组分析 基因序列 基因功能 基因的表达调控 基因产物 基因多态性 比较基因组分析 物种关系 物种进化 物种起源 人、鼠基因组比较 人基因组 鼠基因组 鼠染色体上的颜色和数字代表在人染色体上对应的片段. 老鼠约75%的基因与人类相同。 * * *