使它隆对玉米根部不同微生环境细菌群落多样性的影响-微生物学报.PDFVIP

微生物学报 A cta Microbiologica Sinica 2019, 59(3): 510–522 /actamicrocn DOI: 10.13343/ki.wsxb Research Article 研究报告 “使它隆”对玉米根部不同微生环境细菌群落多样性的影响 1 1 3 3 1 1,2 1* 单凯 ，王春蕾 ，方志军 ，穆春华 ，许艳蕊 ，黄晓文 ，郝鲁江 1 齐鲁工业大学(山东省科学院) ，山东省微生物工程重点实验室，山东 济南 250353 2 齐鲁工业大学(山东省科学院)能源研究所，山东 济南 250014 3 山东省农业科学院玉米研究所，山东 济南 250100 摘要：【目的】研究除草剂“使它隆 ”施用后对玉米根部不同微生环境细菌群落结构和多样性的影响。 【方法】利用Illumina Miseq 高通量测序技术，对玉米根系内生菌、根际和非根际土壤细菌 16S rRNA 的 V4–V5 可变区序列进行测定，分析不同生长期喷施除草剂使它隆对玉米土壤细菌及根系内生菌群落 结构和多样性的影响。【结果】本研究15 个样品共得到 544393 条有效序列，333565 条优质序列。多样 本共有 OTU 分析表明，非根际和根际土壤的群落结构更为相似，在一定程度上说明玉米根部相关细菌 的定殖具有选择性并且是从根际到根系逐步专一化。丰度等级曲线和 Alpha 多样性结果显示非根际和根 际土壤群落的丰富度和均匀度较高，而玉米根系内生菌群落的丰富度和均匀度都比较低，且成熟期玉米 根系内生菌群落的丰富度在施用除草剂使它隆后下降比较剧烈。群落组成分析发现，使它隆除草后，玉 米根部相关细菌各时期在门及属水平上的分布都发生了较大变化。菌群代谢功能预测结果表明玉米生长 从苗期到成熟期，微生物的生长压力逐渐加大，需要消耗更多的能量用于新陈代谢和环境适应。【结论】 施用除草剂使它隆后会降低玉米根部土壤细菌群落的多样性，使它隆对成熟期玉米根系内生菌群落影响 最为显著。 关键词：高通量测序，玉米，使它隆，细菌多样性 玉米作为重要的粮食作物，在山东省农业生 草剂能够改变土壤微生物的群落结构和活性，影 产、经济发展中占有重要地位。玉米田杂草发生 响微生物种群和数量[2] ，对玉米根系内生菌也会产 种类多，数量大，发生期长，危害重，是影响玉 生影响。微生物是生态系统中有机物的主要分解 米高产优质的主要障碍[1] 。除草剂具有省时、省力、 者，在生态系统中具有非常重要的地位。植物内 高效、增产等优点，在农业上被广泛使用。但除 生菌和土壤微生物作为与生产者植物最为密切的 基金项目： 山 东 省 自 然 科 学 基 金(ZR2012CM019) ； 山 东 省 科 技 发 展 计 划 项 目(2014GNC111014) ； 山 东 省 重 点 研 发 计 划 (2015GNC113001) ；齐鲁工业大学(山东省科学院)青年博士合作基金(2017BSHZ007) *通信作者。Tel/Fax ：+86-531；E-mail ：lujiang_hao@ 收稿日期：2018-04-27 ；修回日期：2018-07-30 ；网络出版日期：2018-11-20 单凯等 | 微生物学报, 2019, 59(3) 511 生物，对植物的生长有重要的影响，反过来植物 影范围外距离根系 5 cm 的土样。将采集后的样品 对于内生菌和土壤微生物的群落结构和组成也有 低温保存带回，置于–80 °C 冰箱备用。试验于玉 一定的影响[3] 。 米 3–5 叶期时施药，药剂用量参照说明书。经使 使它隆，学名氯氟吡氧乙酸(4-氨基-3,5-二氯-6- 它隆处理过的非根