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生物资源 2018,40(5):430~442
BioticResources
DOI:10.14188/j.ajsh.2018.05.007
专性海洋放线菌盐孢菌的研究进展
1,2,3 1,2,3 1,3∗
王可欣 ,陈柔雯 ,田新朋
(1. 中国科学院南海海洋研究所 中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室,广东 广州 510301;
2. 中国科学院大学,北京 100049;3. 广东省海洋药物重点实验室,广东 广州 510301)
摘要:盐孢菌属(Salinispora)作为首个被报道的专性海洋放线菌,主要分布于热带和亚热带海洋沉积环境中,在海绵、海
鞘中也有发现。与其他大多数放线菌一样,盐孢菌属的菌株可以产生大量具有抗细菌、抗病毒、抗肿瘤细胞活性、结构新颖的
次级代谢产物且表现出物种特异性。全基因组序列分析显示,盐孢菌属菌株基因组中超过10%的基因序列与次级代谢产物合
成相关,但绝大多数生物合成基因簇编码的产物未被发现,表明盐孢菌属还存在巨大的生物合成潜能,有待深入发掘。目前新
的培养方法、测序技术及生物信息学、基因组发掘技术、合成生物学技术的发展对提升盐孢菌属菌株新型药物的生产潜力发挥
重要作用。本文对盐孢菌属的物种多样性、系统分类与化合物发现等方面的研究进行了系统综述。
关键词:盐孢菌属;专性海洋放线菌;次级代谢产物;生物合成;基因组发掘
中图分类号:P 745 文献标识码:A 文章编号:2096⁃3491(2018)05⁃0430⁃13
AdvancesinthemarineobligateactinomycetegenusSalinispora
1,2,3 1,2,3 1,3∗
WANGKexin ,CHENRouwen ,TIANXinpeng
(1.SouthChinaSeaInstituteofOceanology,CASKeyLaboratoryofTropicalMarineBio⁃resourcesandEcology,Guangzhou
510301,Guangdong,China;
2.UniversityofChineseAcademyofSciences,Beijing 100049,China;
3.GuangdongKeyLaboratoryofMarineMeteriaMedica,Guangzhou510301,Guangdong,China)
Abstract:Salinispora isthefirstreportedmarineobligateactinomycete,whichiswidelydistributedintropicaland
subtropicalmarinesediments,andsomearediscoveredinspongesorascideansassociatedenvironments. Likemostacti⁃
nomycetes,Salinispora strainshavepotentialtoproducelargenumberofnovelsecondarymetaboliteswithexcellentactiv⁃
itiessuchasantibacterial,antiviral,anti⁃tumorcell. Andthesesecondarymetabolitesshowtheobviousspecies⁃specific
relationshipamongthemembersofthisgenus. Genomesequencinganalysisshowsthatover 10%ofthegenomesequenc⁃
esareassociatedwiththesecondarymetabolitessynthesis,whi
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