亚洲韧皮杆菌兼性厌氧型伴生细菌鉴定及优势菌群分析.pdfVIP

微生物学通报 SEP 20, 2011, 38(9): 1362−1370 Microbiology China © 2011 by Institute of Microbiology, CAS tongbao@ 研究报告 亚洲韧皮杆菌兼性厌氧型伴生细菌鉴定及 优势菌群分析 1 1 2 1 3 1* 李颜方 殷幼平 王玉玺 李佳 陈世伟 王中康 (1. 重庆大学 生物工程学院基因工程研究中心 重庆 400030) (2. 农业部全国农业技术推广服务中心 北京 100126) (3. 广西利添生物科技发展(合浦)有限公司 广西 北海 536128) 摘 要: 以定向分离培养和基于16S rDNA 的PCR-DGGE (Denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE)方法, 分析感黄龙病柑橘与健康柑橘植株不同部位的内生细菌多样性, 分离柑橘组织共获 得 19 株可培养的兼性厌氧型内生细菌, 经形态、生理生化结合 16S rDNA 分子方法鉴定其隶属于 12 个属, 其中短小杆菌属Curtobacterium sp. (IF: 29.07%) 、芽孢杆菌属Bacillus sp. (IF: 23.12%)和 微杆菌属 Microbacterium sp. (IF: 21.09%) 为罹病植株的优势菌群, 芽孢杆菌属 Bacillus sp. (IF: 21.03%) 、动性球菌属Planococcus sp. (IF: 20.69%)和假单胞菌属Pseudomonas sp. (IF: 17.44%) 为无 症健株的优势菌群。对DGGE 方法得到的50 条 16S rDNA 目标条带进行序列比对, 共鉴定出9 个 属的细菌, 结果表明沙雷氏菌属Serrations sp. (IF: 28%)是优势菌属, 泛菌属Pantoea sp. (IF: 14%) 是次优势菌属; 病果桔络中黄龙病菌含量最高(1%), 而罹病植株其他部位的黄龙病菌丰度较低。 PCR-DGGE 图谱也显示感病和健康柑橘组织的内生细菌存在差异。 关键词: 黄龙病, 内生细菌, 定向分离培养, 16S rRNA 多样性分析 Isolation of facultative anaerobic entophytic bacterial companioned Ca Las infected citrus tissues and evaluation of dominant bacterial populations LI Yan-Fang1 YIN You-Ping1 WANG Yu-Xi2 LI Jia1 CHEN Shi-Wei3 WANG Zhong-Kang1* (1. Bioengineering College , Chongqing University, Chongqing 400030, China) (2. Ministry of Agriculture, Agricultural Technique Extension and Service Center, Beijing 100126,