祼子植物的分子系统发育、分歧时间估计和适应性选择检测-植物学专业论文.docx

裸子植物的分子系统发育、分歧时间估计和适应性选择检测摘要 裸子植物的分子系统发育、分歧时间估计和适应性选择检测 摘要 裸子植物是现存种子植物中的一大分支，其系统发育关系(尤其是盖子植物 纲的系统位置)对于我们了解种子植物的进化具有极其重要的意义。本论文收集 并测定了世界范围内涵盖16科7l属(属等级约占83．5％)的裸子植物类群的核 18S、26S、叶绿体16S、rbcL、matK、rps4和线粒体coxI、atpI的分子序列数据， 力图在基于溯祖理论的模型指导下，利用上述8基因，以最大似然法(ML)等 统计模型和STAR、STEAC和MPEST等软件重建真实的裸子植物物种树，分析 采样数量、快速进化位点对构建物种树的影响，同时对造成裸子植物系统发育关 系复杂的生物学因素进行探讨。 基于8个基因的分析结果表明，所有单基因数据和基因联合数据都支持被子 植物、银杏纲、苏铁纲、买麻藤纲、松科和非松科植物分别成一单系。18S基因 ML系统发育树支持松杉纲成一单系，而松杉纲与买麻藤纲成姊妹群；26S基因 ML系统发育树支持买麻藤纲与被子植物成姊妹群，银杏纲和苏铁纲成为姊妹群， 松杉纲为一单系类群；叶绿体16S基因ML系统发育树中松杉纲成并系类群，买 麻藤纲和非松科植物成姊妹群；叶绿体rbcL基因ML系统发育树分辨率低，各 大类群成平行支：叶绿体marK基因ML系统发育树分辨率最高，该基因树中