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- 2019-05-28 发布于福建
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第四章:洗核酸序列检索与分析
第四章: 核酸序列检索与分析 主讲教师: xxx 答疑电话: 13xxxx76 Email: yixxxxin@ 核酸序检索 启动子序列定位及功能预测 基因表达读框分析 核酸局部序列比对分析 主要数据库介绍 Genebank Genebank库包含了所有已知的核酸序列和蛋白质序列,以及与它们相关的文献著作和生物学注释。它是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立和维护的。 NCBI的网址是: EMBL核酸序列数据库由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护的核酸序列数据构成,查询检索可以通过通过因特网上的序列提取系统(SRS)服务完成。 数据库网址是:http://www.ebi.ac.uk/embl/ DDBJ数据库日本DNA数据仓库(DDBJ)也是一个全面的核酸序列数据库,与Genbank和EMBL核酸库合作交换数据。使用其主页上提供的SRS工具进行数据检索和序列分析。 DDBJ的网址是:http://www.ddbj.nig.ac.jp/ NCBI介绍:NCBI建立在1988年,作为一种公共分子生物学信息资源, 而创建的公开数据库。 NCBI的计划:1.基本研究;2.数据库;3.软件的开发;4.教育和训练 现在我们以查找“大鼠心肌肌凝蛋白轻链2”的基因序列为例,介绍如何从NCBI中在线获取所需要的核酸序列. 大鼠心肌肌凝蛋白轻链2(其英文名称为:myosin
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