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地址: 上海市浦东新区张江高科技园区李冰路151号(201203) 电话: 021 传真: 021公司网站: HYPERLINK 客户服务热线: 8008205086 / 4008805086
《样本采集、储存与运输指南》
一、样本准备应该遵循的基本原则
代表性原则:取样的代表性关系到实验结果是否具有科学意义,因此您应该根据实验目的慎重选择您的取样方案。病变组织样本中应不夹带正常组织,正常组织样本中不能含有病变组织。有条件时,应做到实验组与对照组的样本在取材时间、部位、处理条件等方面尽可能保持一致,否则可能会影响实验结果的可信度。
准确性原则:代表性样本的各种特征数据必须被准确记录,并按要求(低温、迅速)采集、制备、贮存、运输,最终正确地按实验设计进行实验和数据处理。
迅速性原则:样本质量是影响表达谱芯片实验结果的最关键因素,因此用于表达谱芯片研究的样本,在采集、制备、贮存、运输过程中应尽可能地做到迅速,最大限度的缩短从样本采集到实验的时间。
低温原则:所取样本离体后,应立即置于液氮中,并保证在实验前始终处于-70℃以下,以避免RNA的降解。
二、样本采集(适于表达谱芯片及SNP芯片样本)
1.贴壁细胞
1)贴壁细胞培养诱导结束后,去除培养液;
2)加入适量的1xPBS缓冲液(PH~7.2)快速冲洗一次,彻底去除PBS缓冲液;
3)每10 cm2 细胞加1mL TRIzol或 Lysis/Binding Solution(AMBION);
4)使用1mL移液器Tip头反复吹打细胞,直至细胞充分溶解至无絮状物;
5)将裂解液转移到RNase-free 的离心管中;
6)放入-80℃
2.悬浮细胞
1)悬浮细胞培养诱导结束后,转至1.5 mL离心管中,3,000rpm离心5分钟去除培养液;
2)加入适量的1xPBS 缓冲液(PH~7.2)重悬细胞,3,000rpm离心5分钟去除PBS 缓冲液;
3)5×106细胞加1 mL TRIzol或102的细胞加300 μL Lysis/Binding Solution (AMBION)或102-107的细胞加600 μL Lysis/Binding Solution(AMBION),涡旋或使用1mL移液器Tip头反复吹打细胞直至细胞充分溶解至无絮状物;
4)放入-80℃
3.细菌、酵母
1)溶菌酶或液氮冰冻研磨破壁;
2)按1×107细菌加1 mL TRIzol或Lysis/Binding Solution(AMBION),涡旋或使用1mL移液器Tip头反复吹打细胞直至细胞充分溶解至无絮状物;
3)放入-80℃
4.血液(抽提DNA)
1)采集1-2mL全血,迅速转入EDTA抗凝管中;
2)颠倒抗凝管8-10次,充分混匀EDTA和全血,保证抗凝效果;
3)放入-20℃或-80℃
5.血液(抽提RNA用于表达谱芯片,建议采用BD的PAXgene管抽取全血)
※PAXgene管法
1)采集2.5mL全血入PAXgene管中;
2)颠倒混匀8-10次,室温(18-25℃)放置2小时
3)放入-20℃或-80℃
※EDTA抗凝管法
1)采集2-3mL全血,迅速转入EDTA抗凝管中;
2)颠倒抗凝管8-10次,充分混匀EDTA和全血,保证抗凝效果;
3)放入4℃冰箱中保存
以下两种方法有可能在操作过程对基因的表达产生影响:
※淋巴细胞分离液
1)在EDTA抗凝的新鲜全血中加入等体积1×PBS,充分混匀;
2)另取一新的离心管,加入与稀释血液等体积的淋巴细胞分离液,沿管壁缓慢将稀释血液加入到该离心管中,使稀释血液处于淋巴细胞分离液液面之上(即两种液体不要混合,保留清晰的界面),水平2000rpm(400g)离心30 min;
3)离心后,管内液体分为三层,上层为血浆和PBS,下层主要为红细胞和粒细胞。中层为淋巴细胞分离液,在中上层液面处有一白色云雾层狭窄带,即为富含淋巴细胞和单核细胞的单个核细胞(PBMC)及血小板;
4)吸去最上层的血浆,收集血浆层和淋巴细胞分离液交界面的单个核细胞,尽量全部吸出PBMC,移入一新的离心管中;
5)加入5倍1×PBS,混匀后离心200×g 10分钟,弃去上清液(低速离心有利于去除细胞悬液中留存的血小板);通常每毫升外周血可得
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