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Nucleotide 该数据库由国际核苷酸序列数据库成员美国国立卫生研究院GenBank、日本DNA数据库(DDBJ)和英国Hinxton Hall的欧洲分子生物学实验室数据库(EMBL)三部分数据组成。 这三个组织联合组成国际核苷酸序列数据库协作体，每天交换各自数据库中的新增序列记录实现数据共享。 其中的核酸序列数据也通过与基因组序列数据库(GSDB)合作获取。 选择数据库 输入关键字 NCBI主页 进入Entrez检索 Entrez简介 Entrez是个全局的生物医学搜索引擎，他可以检索的数据库主要包括三类： （1） 文献数据库：PubMed，PubMed Central， Journals,Books,OMIM,OMIA。 （2） 序列数据库：Nucleotide,Protein,Genome, Strcture,SNP。 （3） 其他数据库：Taxonomy，Gene， Probe,PopSet等 无对应结果 相关的结果 Entrez检索的结果 Entrez 功能强大，在于它的大多数记录可相互链接，既可 在同一数据库内链接，也可在数据库之间进行链接。 Entrez browser来查询各种数据(集成搜索工具) 基因组的相关的信息 查看详细结果 详细结果 序列部分 注释部分 下载格式选择 注释部分 基因位点（Locus）、基因定义（Definition）、基因存取号（Accession)、关键词（Keywords）、 来源（Source）、组织分类（Organism）、参考文献（Reference）、 著者（Author）、题目（Title）、期刊（Journal）、序列特征（Features）、基因（Gene）、蛋白质编码序列CDS(cDNA） 、5’非翻译区（5’UTR）、 3’非翻译区3’UTR）、mRNA的polyA位置（polyA_site）、信使RNA（ mRNA ）、外显子（ exon ）、内含子（ intron ）、原序列（Origin）。 常用序列格式：FASTA格式 1.定义： 在生物信息学中，FASTA格式（又称为Pearson格式），是一种基于文本用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来编码，且允许序列前添加序列名及注释。通常核苷酸符号大小写均可，而氨基酸常用大写字母。 2.特点： 简单 使用最多 例子(单序列)： gi|9629267|ref|NC_001798.1| Human herpesvirus 2, complete genome AGTCCCCGTCCTGCCGCGCGGGGGCGGGCGCGGGAAAAAAGCCGCGCGGGGGCGCCCGCGGGAAGGCAGC CCCGCGGCGCGCGGGGGGAGGGGCGGCGCCCGCGGGGGAGCGGCCGGCTCCGGGGGAGGGACGGGGAAGG ………. 多序列FASTA sequence1, E. coli ctgcgagNcgcgcgatgatagMMM-NNNngnnatgancgcggcgagcatgtagcatgcta gctgtcgcgagcactUgaURRRrrrtrrrcggccgagatcaggcgatgcatgcgcagggagcagcgagcgacgagcacagcatgctagctagatgcatgctaVagvcgtaggcagccgcc sequence2, B. subtilis ctgcgagNcgcgcgatgatagctgactNntnatganncgcggcgagcatgtagcatgctagctgtcgcgagcactUctURRRrrrcrrrcggccgagatcaggcgatgcatgcgcagggagcagcgagcgacgagcacagcatgctagctagatgcatgctaVcgvcgtaggcagccgcc sequence3, B. natto ctgcgagNcgcgcgatgatagMcgatcccnatgannncgcggcgagcatgtagcatgctagctgtcgcgagcactUggURRRrrrggrrcggccgagatcaggcgatgcatgcgcagggagcagcgagcgacgagcacagcatgctagctagatgc