不同镉积累基因型烟草CAX2基因克隆及序列分析.pdfVIP

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2019-04-06 发布于广西
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南方农业学报 Journal of Southern Agriculture 2015 ，46（2 ）：181-187 2 期 http ：// ISSN 2095-1191 ； CODEN NNXAAB ：： DOI 10.3969/j issn.2095-1191.2015.2.181 不同镉积累基因型烟草CAX2基因克隆及序列分析 1 2 1 3 1 1 * 郭园园，陈江华，周慧娜，商慧文，翟妞，张艳玲 1 2 3 （郑州烟草研究院，郑州 450001 ；中国烟叶公司，北京 100009；许昌市烟草专卖局，河南许昌 461000）摘要：【目的】克隆不同镉积累基因型烟草中阳离子转运基因（CAX2 ），为研究烟草CAX2基因在镉转运过程中的作用机理提供参考。【方法】根据NCBI 中马铃薯的CAX2 序列，BLAST 烟草EST数据库，设计引物克隆普通烟草（Nicotiana tabacum ）K326和黄花烟草（N . rustica ）的CAX2基因，使用生物信息学方法进行序列分析。【结果】K326和黄花烟草CAX2基因（分别命名为NtCAX2和NrCAX2 ）编码区长度均为1314 bp，核苷酸序列一致性达98.0% ；二者均编码 + 2+ 437个氨基酸，仅有5个氨基酸位点存在差异。NtCAX2和NrCAX2蛋白同源性为98.9% ，均有两个完全相同的Na -Ca 交换蛋白结构域，分别位于CAX2 102~249 aa和293~426 aa 区域，具有CAX家族共有的结构特征。 NtCAX2和NrCAX2理论等电点分别为5.54和5.45 ，均有较强疏水性，包含11个跨膜结构域和两个重复区域α-1、α-2 ，三级结构以α-螺旋为主。系统进化分析结果表明，NtCAX2和NrCAX2与马铃薯（StCAX2 ）的亲缘关系最近，蛋白同源性均高于92.0%。【结论】K326和黄花烟草CAX2基因同源性较高，CAX2基因在茄科具有较高保守性。关键词：普通烟草；黄花烟草； CAX2 基因；序列分析；镉转运中图分类号： S572 文献标志码：A 文章编号：2095-1191（2015 ）02-0181-07 Ｃloning and sequence analysis of ＣAX2 from two nicotiana genotypes with different Ｃd accumulating pattern 1