广西巴马小型猪PPARγ基因克隆及组织表达差异分析.pdfVIP

南方农业学报 JournalofSouthernAgriculture 2017，48（10）：1884-1890 ·1884· ISSN2095-1191；CODENNNXAAB 南 方 农 业 学 报 48卷 DO ：10.3969/j.issn.2095-1191.2017.10.24 广西巴马小型猪PPARγ基因克隆及 组织表达差异分析 * * 申玉建，方 程，邱庆庆，司景磊，吴延军，杨祝良，杨秀荣，郭亚芬，蒋和生 （广西大学 动物科学技术学院，南宁 530004） 摘要：【目的】克隆广西巴马小型猪过氧化物酶增殖物激活受体γ基因（PPARγ），并确定其在不同组织中的表达情 况，为后续研究该基因在猪支原体肺炎（MPS ）中的作用机制打下基础。【方法】利用RT-PCR克隆广西巴马小型猪 PPARγ基因，并进行BLAST 比对分析及其推导蛋白的生物信息学分析；以实时荧光定量PCR检测PPARγ基因在18月龄 广西巴马小型猪心脏、脾脏、肺脏、肾脏、大肠、小肠、肌肉和脂肪中的表达情况。【结果】广西巴马小型猪PPARγ基因开 放阅读框序列1515 bp ，编码504个氨基酸。广西巴马小型猪PPARγ基因推导氨基酸序列与GenBank 已发表的猪 PPARγ基因（FJ436399.1）推导氨基酸序列同源性最高，达100.0% ；而与牛（NM_ 181024.2 ）、人类（NM_005037.5）、猕猴 （NM_001032860.1）、鼠（NM_001308354.1）和鸿雁（KJ019822.1）的同源性分别为92.9%、91.8%、91.5%、90.5%和83.5% ， 表明PPARγ基因高度保守。PPARγ蛋白分子量为57380.91 Da ，理论等电点（pI ）为6.88 ，不稳定系数49.26 ，脂肪指数为 88.21 ，亲水性平均水平为-0.293 ，为亲水性蛋白，其二级结构主要是α-螺旋，占总数的39.09%。PPARγ基因在广西巴马 小型猪大肠组织中的表达量最高，极显著高于其他组织（P0.01 ），而在肾脏、心脏和肌肉组织中的表达量极低。【结 论】PPARγ基因在18月龄广西巴马小型猪的各组织中均有表达，但不同组织中的表达水平存在明显差异，可能与其在 不同组织中的功能差异有关。 关键词：广西巴马小型猪；PPARγ基因；猪肺炎支原体；克隆；组织表达差异；炎症调控 中图分类号：S828.89 文献标志码：A 文章编号：2095-1191（2017 ）10-1884-07 CloningofgenePPARγfromGuangxiBamamini-pigand tissueexpressiondifferenceanalysisforit SHEN Yu-jian ，FANG Cheng ，QIU Qing-qing ，SI Jing-lei ，WU Yan-jun ， * * YANG Zhu-liang ，YANG Xiu-rong ，GUO Ya-fen ，JIANG He-sheng （College of Animal Science Technology ，Guangxi University ，N