第三章生物信息学资源与数据挖掘工具教材编辑.ppt

第三章 生物信息学资源与数据挖掘工具;NCBI;EBI;NIG;其他重要中心;二、数据库目录;NAR数据库专辑;其他数据库列表;三、常用序列格式;FASTA序列格式;多序列FASTA;FASTA序列格式中的核苷酸表示法;FASTA序列格式中的氨基酸表示法;PHYLIP序列格式;四、核酸数据库;国际核苷酸序列数据库联盟;GenBank主页;GenBank结构;GenBank查询(1);GenBank查询;GenBank查询：Protein;GenBank序列格式;GenBank查询;向GenBank投递序列;BankIt;Sequin;EMBL主页;DDBJ主页;BioSino;DNA结构数据库;RNA序列和核糖体数据库;基因图谱数据库;GDB (人类基因组) GDB代谢数据库 HGVbase [瑞典] (变异,双等位序列) HGMD [英] (变异) hum-molgen (分子遗传) OMIM (遗传,变异) HUGE [日] (未经证实的编码基因) CEPH Genotype [法] (SNP)、p53 [法] HIB [德] (来自UniGene);其他模式生物的基因组数据库;五、蛋白数据库;一级结构 二级结构 三级结构;多级蛋白序列数据库??构;SWISS-PROT;TrEMBL;PIR(1);PIR(2);PROSITE;由 EBI 和瑞士创办 有详细注释的序列，数