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- 2019-08-05 发布于江苏
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人、小鼠、大鼠血红蛋白及其编码基因序列分析
姓名________ 学号______________ 组号_________ 日期__________年___月___日
认真阅读NCBI书架(Bookshelf)、PDB分子月报(Molecule of the Month)、UniProt蛋白质精选(Protein Spotlight)以及维基百科(Wikipedia)等网站中有关血红蛋白的介绍,了解血红蛋白的生理功能、空间结构、亚基组成等基本知识。
查阅ENSEMBL基因组数据库中已经或正在进行基因组测序的物种树,了解人、小鼠、大鼠三个物种之间演化关系;检索物种分歧时间数据库TimeTree,了解人和小鼠、小鼠和大鼠之间的分歧时间。
从UniProt数据库中检索并提取人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha亚基蛋白质序列,利用WebLab或JEMBOSS软件包中的序列比对程序Needle,选择默认计分矩阵BLOSUM62和默认空位罚分进行序列比对,将比对结果填入表1。分析比对结果,说明得到上述结果的原因和进一步分析思路。
表1 人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha亚基蛋白质序列比对结果
物种
Species
登录号
Accession
得分
Score
相同氨基酸
Identity
相同和相似氨基酸
Similarity
空位
Gaps
人/小鼠
/
人/大鼠
/
小鼠/大鼠
/
检索Ref
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