“Discovery-Studio-2.5中基于药效团的药物设计方法和应用-”.ppt

DS2.5中基于药效团的药物设计方法和应用; What’s new in DS2.5.5以及DS2.5Visualizer使用方法 DS2.5中基于药效团的药物设计方法和应用 生物大分子间相互作用的识别工具及其在生命科学和药物设计中的应用 DS 2.5中的QSAR（2D、3D）方法介绍和应用 真正的生物实验数据登录管理系统-BioRegistration Spotfire帮您加快药物研发速度 应用于生物信息学中的数据库和分析工具 如何通过Neo-CADD帮助实验人员更快设计和优化药物分子;pharmacophores;Pharmacophores（药效团模型）;药效特征元素;Catalyst应用实例;Catalyst(Linux);catalyst;catalyst;新结构先导化合物发现 先导化合物结构优化 识别分子靶标;---基于配体的药效团模型;16 compounds(training set);Training set:;产生多个药效团模型;模型验证;模型验证;虚拟筛选;化合物库筛选;寻找与化合物活性相关的药效团特性 构建的药效团模型具有活性预测功能;实例分析2（先导化合物优化）;Training set:;Test set;IC50=1.43;实例分析3; 对于训练集要求： - 输入的分子结构具有多样性 - 化合物数目在2-32个，6个左右比较理想 - 只选用具有活性的分子 - 需要包含Principal和MaxOmitFeat性质 方法总结 - 找到一组化合物的公共药效特性 - 不需要SAR的信息 - 使用有活性的化合物作为输入结构 - 返回一组公共的药效特性 - 产生的药效团根据打分排序 - 可同时处理大量分子 - 多种不同格式的分子(*.cpd, *.mol2, *.mmod) ;实例分析3;A;A;HypoGen and HipHop;---基于受体的药效团模型;药效团模型： 基于受体结构的药效团应用;药效团模型： 基于受体结构的药效团应用案例;Ligand Profiler;药效团数据库(PharmaCoreDB & HypoDB); PDE5（磷酸二酯酶5）抑制剂的问世使男性勃起功能障碍的治疗手段发生了根本性的改变 。;Compound：目前已上市的5个PDE5抑制剂 PCDB：与INFLAMMATION相关的药效团模型 -1XOS：PDE4B与SILDENAFIL（西地那非复合物结构） -2H44：PDE5A1与Icarisid II（宝藿苷I复合物结构 ） DS Ligand profile;结果分析; What’s new in DS2.5.5以及DS2.5Visualizer使用方法 DS2.5中基???药效团的药物设计方法和应用 生物大分子间相互作用的识别工具及其在生命科学和药物设计中的应用 （蛋白-DNA相互作用；抗原-抗体相互作用；DNA-DNA相互作用； 多肽药物设计） DS 2.5中的QSAR（2D、3D）方法介绍和应用 真正的生物实验数据登录管理系统-BioRegistration Spotfire帮您加快药物研发速度 应用于生物信息学中的数据库和分析工具 如何通过Neo-CADD帮助实验人员更快设计和优化药物分子;Spotfire Seminar（主题：Spotfire在药物研究中的应用） 5月31日上午，北京Seminar 6月2日上午，上海Seminar 具体通知请关注我们的网站 2010生命科学暑期培训班 计划在7月份举办（北京，上海） 内容覆盖DS和PP的入门和高级培训，Spotfire和CLC的入门培训 2010年创腾科技用户会 9月份在武汉举办 欢迎所有新老朋友的参与 ;