课件：交互作用.ppt

分析程序 Power 3.0 GxEscan - Detect GxE interactions in a genome-wide association study GxGscan - Detect GxG interactions in a genome-wide association study PriorityPruner - a software program which can prune a list of SNPs that are in high linkage disequilibrium (LD) with other SNPs in the list, while preferentially keeping/selecting SNPs of higher priority (e.g., the most significant SNPs in a genome-wide association study). 课题申请与学位论文 NSFC 2014-22项 NSFC 2014-22项 NSFC 2014-22项 NSFC 2013-25项 NSFC 2013-25项 NSFC 2013-25项 C060701:生命科学部-遗传学与生物信息学-生物信息学-生物数据分析 NSFC重大项目 “环境与遗传因素及其交互作用对慢性非传染性疾病影响的队列研究” 医学科学部重大项目指南（2013） 资助期限 5年 （2014年1月至2018年12月） 资助经费 1800万元 NSFC重大项目 慢性非传染性疾病（以下简称慢性病）已经成为我国最主要的公共卫生问题，对慢性病病因及其预防对策的研究是国家的重大需求。 多年来的研究表明：人类主要慢性病的发生受个体行为和环境因素等外因与遗传内因交互作用的影响。 国民生活环境和饮食行为方式发生的深刻变化，对疾病的发生、发展和疾病谱的改变产生了显著的影响。 NSFC重大项目 基因组学和表观遗传学等系统生物学技术的飞速发展，又极大地推动了遗传和表观遗传等生物标志物在人群水平的广泛应用，使基于自然人群队列的慢性病环境与遗传因素及其交互作用的研究成为可能。 队列研究是疾病病因研究和防治措施评价的重要流行病学方法和循证医学科学证据重要来源之一。 该研究设计能够更有效控制各类偏倚、科学评价环境和遗传因素的人群效应、探讨暴露与效应的因果关系。 因此本项目将基于国内已建立的大样本前瞻性自然队列人群，进行慢性病环境和遗传因素及其交互作用的研究，为慢性病的预防提供研究基础。 NSFC重大项目 一、科学目标 在已建立的大样本自然人群队列研究的基础上，围绕“环境与遗传因素在慢性病发生发展过程中的交互作用”这一主题开展研究。 发现和探讨我国常见慢性病的主要危险因素，揭示我国人群慢性病疾病谱的长期变化规律和特征； 筛选和验证我国人群主要慢性病相关易感基因； 探讨表观遗传学特征与主要慢性病之间的关联及其长期动态变化趋势； 明确与慢性病发病有关的环境因素与遗传因素及表观遗传标志之间的相互作用。 在此基础上构建慢性病风险预测模型并在大样本队列人群中进行评价。提高对主要慢性病高危人群的鉴别能力，实现群体预防和个体预防相结合的目标。 NSFC重大项目 二、研究内容 本项目要求在同一个已建立的大样本自然人群队列基础上，针对1-2个主要慢性病，分别设置以下四个课题： （一）我国主要慢性病流行特征及其主要危险因素队列研究。 （二）我国人群主要慢性病相关易感基因的筛选和验证研究。 （三）基于队列人群的我国主要慢性病表观遗传学研究。 （四）环境与遗传及其交互作用对慢性病发病的影响及风险预测研究。 本项目要求每个课题要紧紧围绕“环境与遗传因素及其交互作用对慢性非传染性疾病影响的队列研究”这一主题开展深入、系统研究，课题间要有紧密和有机的联系。 北京大学公共卫生学院李立明教授主持的项目“环境与遗传因素及其交互作用对冠心病和缺血性脑卒中影响的超大型队列研究”获得2013年国家自然科学基金重大项目资助，金额为1800万。这是国家自然科学基金委员会自组建后设立的第一个公共卫生领域的重大项目。 NSFC 2012-15项 NSFC 2012-15项 学位论文-硕士 TLR4基因多态性及其和环境危险因素交互作用与冠心病的关系 吉林大学 2014 多数量性状的整体基因间交互作用统计推断方法研究 山东大学 2014 原发性高血压不同中医证型患者AT1R基因多态性与内外环境交互作用的分子流行病学研究 安徽中医药大学 2014 高血压家族史与肥胖及高尿酸血症对高血压发病的交互作用研究 青岛大学 2013 FOXO1基因多态性、环境因素及其交互作用与2型糖尿病关系的研究 吉林大学 2013 IGFs基