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生物信息学及人类基因组 黄石 教授 医学遗传学国家重点实验室 Central South University 中南大学 ; 为什么学生物信息学? ;生物信息学主要研究课题;遗传距离(Genetic distance);遗传距离的计算;Is Maximum Genetic Distance (MGD) a common sense?;Molecular Phylogeny 分子种系发生或关系史; 生物信息学离不开进化理论; 新达尔文进化论(Neo-Darwinism); 同源基因序列相似性的两大相关问题;新达尔文进化论的预测;Margoliash, PNAS, 1963;遗传等距离例二;Old notes from my 1983 class on evolution Fudan University ;遗传等距离现象表述;遗传等距离现象直接催生一个反达氏理论, 分子钟和中性理论 Molecular Clock and Neutral theory; 分子钟和中性理论要点; 分子钟和中性理论的价值;Human;; 分子钟和中性理论的问题: 不适用于大进化;Tautology;分子钟/中性理论反证: 物种突变速度不同; 对生物学至关重要,直接催生一个统领进化及生物信息学近半个世纪的不完整理论(可解释小进化等距离)。 是区分大小进化的最佳证据。 ; 建造第一常识公理 First Axiom of Construction 生物第一常识公理 First Axiom of Biology 最大遗传变异假说 Maximum Genetic Diversity Hypothesis ;直觉与科学(Intuition and Science);建造第一常识公理 First Axiom of Construction; Epigenetic complexity is organismal complexity;生物物种复杂性即表观遗传复杂性 Epigenetic Complexity;同源基因点突变遗传变异多样性 Genetic Diversity;生物第一常识公理: 遗传变异多样性与表观遗传复杂性成反比关系 Inverse relationship between genetic diversity and epigenetic complexity;最大遗传变异假说 The Maximum Genetic Diversity Hypothesis;;最大遗传变异假说 The Maximum Genetic Diversity Hypothesis;快变与慢变基因;小进化Microevolution, 大进化 Macroevolution;Microevolution and Macroevolution; 最大遗传变异假说与基因功能域;;最大遗传变异假说是遗传等距离现象的理论基础;;;;A test;Yeast 2;Human;   ;Contrast between the MGD hypothesis and the modern evolution theory (MET);;NCBI, 最常用的数据分析及获取平台;   ;基本局部比对搜索工具(Basic Local Alignment Search Tool) 应用最广泛的相似性搜索工具 Alt schul等人于1990年在NCBI发布 基于Smith-Waterman的局部比对算法;软件功能; ;人类基因组研究主要数据,SNP Single Nucleotide Polymorphism;人类基因组研究主要发现;人类基因组研究主要发现: 现代人类出非洲说;目前的人类基因组研究课题;总结;有问题请随时来我办公室或email. huangshi@sklmg.edu.cn;Venter基因组变异范围比Watson小;跟酵母比,人比线虫稍微近一点; 本人代表性生物信息学论文 ; ; ;The overlap feature is evidence of maximum genetic distance;分子钟/中性理论反证: 大进化遗传等距离现象的两大特征;遗传等距离现象两大特征图解;分子钟/中性理论反证: 不能解释大进化遗传等距离现象的重叠特征;;一个细胞有时可代表一种独特的表观遗传编程程序;表观遗传编程有多种方式抑制DNA随机变异;熵 Entropy

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