计算机辅助对一系列酶和蛋白质与其抑制剂的结合方式的研究-农药学专业论文.docxVIP

摘 摘 要 本文利用计算机辅助，对几种靶酶与其抑制剂小分子的结合情况进行了研 究。 在受体乙酰乳酸合成酶(ALS)三维结构未知的情况下，采用距离比较法 (DISCO)抽提出靶酶ALS抑制剂的药效团模型。 根据的菠菜光合作用系统II的Dl蛋白的氨基酸序列，利用其同源蛋白(细 菌cyanobactefium Thermosynechococcus elongatus的光合系统II的D1蛋白)的 晶体结构，同源模建了菠菜D1蛋白的三维空间结构。 利用已建立的菠菜Dl蛋白的3D结构和原卟啉原氧化酶(PPO)、对羟苯基 丙酮酸双氧化酶(HPPD)的晶体结构，运用软件Flexx将各类蛋白质与其抑制 剂小分子进行对接，研究了其结合方式。 关键词：药效团，分子对接，FlexX，同源模建，乙酰乳酸合成酶(ALS)，光合 系统Ⅱ，Dl蛋白，对羟苯基丙酮酸双氧化酶(HPPD)，原卟啉原氧化酶(PPO)。 I 朱褫瓣蔼勿垒立公布一 AbstractAbstract Abstract Abstract The binding conditions of severl enzyme with their inhibitors was researched by the aid ofcomputer chernist珥 Since the crystal stn】chlre of the target enz