模式植物的种类及基因组特点.pptVIP

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  • 2019-05-02 发布于江西
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模式植物的种类及基因组特点 模式植物 模式植物:就是指一种植物的特征很明显的,可以很容易和其他植物区别的植物。 包括藻类等水生植物;拟南芥、烟草、水稻、金鱼草等都是模式植物。 种类以及基因组特点 常见的模式植物 1:拟南芥 2:水稻 3:二穗短柄草 4: 烟草 拟南芥 ABC模型: A类基因决定了花萼的特征; A类+B类基因共同作用决定了花瓣特征; B类+C类基因共同作用决定了雄蕊特征; C类基因单独作用决定了雌蕊心皮的特征,同时也终止花器官在第四轮形成之后继续分化(A)。 拟南芥 在野生型花器官中,这三类基因的表达产物大体按照它们所各自决定的花器官位置,分布于相应的区域。当其中某个基因发生突变之后,它所控制的区域则会发育出其他类型的花器官。 例如,在B类基因的突变体中(B类基因功能消失),第二轮的花瓣 区域由于只受到A类基因的调控,会发育出与第一轮相同的花萼,第三轮的雄蕊也会相应地转化成第四轮的心皮组织(雌蕊的组成部分)(B)。 拟南芥 A、B、C三大类基因都编码转录因子,在花原基的发育过程中会由外到内被逐个激活,从而确保正确的 花器官在准确的时期出现。拟南芥花发育中所使用的这套机制与动物发育中基因表达系统类似。 水稻 ?在洪国藩研究员的领导下,中国科学院国家基因研究中心经过3年多的艰苦奋战,利用已完成的水稻12条染色体的BAC库,在世界上首次成功构建了高分辨率的水稻基因组物理全图。我国科学家在水稻基因组计划研究中取得的这一成果,为最终揭示水稻遗传信息奥秘和农作物育种做出了重大贡献。 水稻基因组由12条染色体组成,总长度为4.3亿核苷酸,水稻基因组研究计划包括三大内容,即水稻基因组遗传图、物理图的构建和DNA全顺序的测定。 水稻的染色体 水稻的物理结构图 二穗短柄草 二穂短柄草拥有迄今所知禾本科植物最小的基因组,仅为272Mbp,染色体基数为5条,包含二倍体(二穂短柄草染色体组)、四倍体和六倍体3种类型,染色体数分别为10、 20和30。 其基因组内含子少,重复序列少,基因密度高,从而使基因库的构建,筛选和测序等过程变得简便、快速,也可节省大量科研经费[3]。如此小的基因组是二穗短柄草成为理想模式植物的又一重要特性。 第1条染色体最大,着丝粒近中部;第2条染色体次之,着丝粒近端部;第3条染色体短臂长度与第2条染色体儿乎相等,着丝粒中部;第4条染色体结构特点与第3条染色休相同,但其长臂上含有一个SS rDNA主要位点;第5条染色体最小,着丝粒近端部,短臂上含有在短柄草中唯一的45S rDNA主要位点。 短柄草属的形成 烟草 栽培烟草属于茄科烟属植物。 栽培烟草2n=4x=48):林烟草(2n=24)和茸毛烟草(2n=24)杂交获得不育杂种,染色体加倍之后,形成了一个相对具有繁殖力的和稳定性的杂种。 栽培烟草有一个非常大的基因组,大约45亿个碱基对,为人类基因组的1.5倍。与人类基因组一样,这些碱基对许多具有很高的重复性。 烟草是异源四倍体,理论上讲每个基因有同样的2条。假设基因组含有60000个独特的基因。这意味着平均烟草基因组每75000个碱基含有一条基因,基因组不到1%的序列为编码序列。 利用浓缩的(异染色体)/开放染色体的(常染色质)区域(非编码序列/编码序列)的甲基化的差异,从而可排除许多非编码甲基化序列,并用注册商标为GeneThresher的技术来完成。一些特殊的细菌能够根据它的甲基化位置提前分类(pre-sort)DNA。将庞大的物理结构图与一个表达序列标记(EST,cDNA)计划相结合,很可能一种特定植物的核基因的90%以上的序列可被鉴定和图谱。

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