基于锁核苷酸LNA-烟草科技.PDFVIP

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2015 年 12 月 烟草科技 Dec. 2015 第48 卷第 12 期 Tobacco Science Technology Vol. 48 No. 12 基于锁核苷酸(LNA)增敏的植烟土壤中烟草 黑胫病菌定量PCR检测方法 1 1 2 1 *1 *1 刘 芳 ,宋纪真 ,范艺宽 ,牟文君 ,奚家勤 ,胡利伟 1. 中国烟草总公司郑州烟草研究院,郑州高新技术产业开发区枫杨街2 号 450001 2. 中国烟草总公司河南省公司,郑州市政七街7 号 450008 摘要:为了快速有效地检测植烟土壤中的烟草黑胫病菌的定殖数量,以一种锁核苷酸(LNA )引物为 基础,进行了植烟土壤中烟草黑胫病菌数量的定量PCR 检测方法研究。结果表明:①与普通DNA 引物相比,LNA 引物提高了PCR 反应的退火温度,减少了引物二聚体和非特异性产物的形成,提高 了烟草黑胫病菌分子检测的灵敏度与特异性;②定量分析检测出14 个烟草- 大蒜轮作土样中烟草 3 4 黑胫病菌的定殖数量为2.76×10 ~5.20×10 个/g ,且在4 ~5 h 内完成检测,具有较高的灵敏度和检测 效率。 关键词:植烟土壤;烟草黑胫病菌;锁核苷酸(LNA );荧光定量PCR ;分子检测 中图分类号:S43 文献标志码:A 文章编号:1002-0861 (2015 )12-0014-06 DOI: 10.16135/j.issn 1002-0861 AQuantitativePCRMethodforDetectingPhytophthora parasitica var. nicotianae inTobaccoPlantingSoilBasedonLNASensitization 1 1 2 1 * 1 * 1 LIU Fang , SONG Jizhen , FAN Yikuan , MOU Wenjun , XI Jiaqin , and HU Liwei 1. Zhengzhou Tobacco Research Institute of CNTC, Zhengzhou 450001, China 2. Henan Province Company of CNTC, Zhengzhou 450008, China Abstract: In order to efficiently detect the colonization of Phytophthora parasitica var. nicotianae in tobacco planting soil, a quantitative PCR method was researched based on locked nucleic acid (LNA ) primer. The results showed that: 1)Comparing with conventional DNA primers, the LNA primer raised PCR reaction annealing temperature, reduced the formation of primer dimers and non-specific products, and improved the sensitivity and specificity of detection. 2 )LNA quantitative PCR analysis revealed that the concentration of Phytophthoraparasitica var. nicotianae in 14

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