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坐标工具栏【Coordinates】 原子列表编辑器【Edit】→【Atom List】 连接关系编辑器 【Edit】→【Connection】 冗余坐标编辑器 【Edit】→【Redundant Coordinates】 点群对称性 【Edit】→【Point group】 有对称性的分子，在计算中使用对称性能 极大的提升计算速度。 练习 从头构建二茂铁分子，并将分子对称化到D5d。推荐步骤如下： 搭建茂环（D5h C5H5） 将搭建好的茂环append一份到窗口中，然后将两个茂环放置为堆积状态，调整环间距离约3.3埃 旋转其中一个环，使两个茂环处于交叉构象，并使用点群对称化。 用在质心加入原子的方法加入铁原子并对称化。 调整键长到标准距离并定义联接关系。 目标键长 RC-C=1.44 RC-H=1.07 RC-Fe=2.10 GV_Exercise_3_OK.gjf 分子轨道编辑器 【Edit】→【MOs】 要查看分子轨道图形需要打开chk或者fchk文件 一些注意事项 连接编辑器 使用鼠标也可对原子进行重排，其操作以参考原子为基础进行: ①左键点击。指定点击原子为参考原子。 ②右键点击。点击原子与参考原子交换原子标签，该原子成为新的参考原子。 冗余坐标编辑器 用于创建和编辑冗余坐标,冗余坐标常用于Gaussian 优化或势能面扫描中。 分子轨道编辑器 注意需从检查点文件中读入文件。 计算工具栏【Calculate】 ◆创建 Gaussian 作业 【Calculate】→【Gaussian Calculation Setup】 【Job Type】选项卡 【Method】选项卡 【Title】选项卡 【Link 0】选项卡 【General】 和【Guess】 NBO、Solvation和PBC 7. 【NBO】面板 8. 【Solvation】面板 9. 【PBC】面板 为计算设置默认值 【File】→【Preferences】→【Gaussian Setup】 在 Gaussian Calculation Setup 对话框的底部可以看到已有的计算方案。 点击【Calculate】→【Gaussian Calculation Scheme】,可弹出 Gaussian Calculation Schemes 窗口，从中选择要使用的计算方案，并应用到当前分子中。 对于新分子，初始将采用 Default 方案。但可以在如下对话框中查看或修改各种已有方案的属性。 底部按钮说明 【Submit】 使用当前输人文件运行 Gaussian 计算。 【Quick Launch】 直接运行Gaussian 作业。 【Cancel】 关闭对话框返回所有选项为默认值。 【Edit】 使用外部文本编辑器直接编辑输入文 件，未保存之前，是不可直接编辑的。 【Retain】 关闭对话框，但输入文件不会被创建或 更新，也不会提交 Gaussian 作业。 【Defaults】 恢复所有的选项为默认值。 【Help】 提供对话框的在线帮助。 快速运行作业 传统方法 点【Calculate】→【Gaussian Calculation Setup】，然后在其中修改其作业选项，完成后点击【Submit】按钮，并为要保存的输入文件指定文件名和文件位置。 快速运行作业 点击【Calculate】→【Gaussian Quick Launch】，或在工具栏的图标 (Quick Launch)上点击右边的下拉菜单，引出含有【Temp File】(从临时输入文件提交计算 作业)、【Save File】(保存输入文件后提交计算作业)以及【Save and Edit File】(保存并编辑后提交计算作业)三项的子菜单。 本机需要安装有Gaussian09软件 观察和控制计算 【Calculate】→【Current Jobs】 该窗口显示了当前正在运行的由 GaussView 启动的所有计算作业(只有本次 GaussView 启动以后的作业才会显示)。 这里显示的作业包括由 Gaussian 对话框提交的 Gaussian 作业、 GaussView 提交的输入文件编辑的 Gaussian 作业以及为创建和显示表面而运行的 Cubegen 这类 GaussianUtilities 作业。 查看 Gaussian 结果 显示结果数据摘要 【Results】→【Summary】 点击 【Results】→【View File】，或在上述对话框中点击【View File】按钮，可打开该计算作业的日志文件(*. log) 显示原子电荷 【Results】→【