基于组合药物网络的疾病关联性分析.pdf

第 １５卷 第 １期 生 物 信 息 学 Ｖｏｌ．１５ Ｎｏ．１ 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 ２０１７年０３月 Ｃｈｉｎｅｓｅ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ Ｍａｒ． ２０１７ － ＤＯＩ：１０．３９６９／ ｊ．ｉｓｓｎ．１６７２ ５５６５．２０１７．０１．２０１６０４００１ 基于组合药物网络的疾病关联性分析 赵媛媛，王　 耘∗ （北京中医药大学中药学院，北京 １００１０２） 摘　 要：组合药物在复杂疾病的治疗中形成了多靶点，多环节上的密切联系，对疾病的治疗效果也可达到单种药物治疗意想 不到的效果。 组合药物中各单药功能各异但联用后治疗效果更佳，说明所对应疾病之间可能存在某种关系。 通过研究疾病 间关联关系，可能会发现治疗某种疾病的新靶标，从而在新药的研发中取得新的进展。 本文以ＤＣＤＢ（组合药物数据库）中的 药物组合为数据源构建组合药物网络，并通过网络聚类算法得到了３３个独立且内部联系紧密的药物模块。 其中７ 组药物模 块所包含的组合药物用于治疗两种或两种以上疾病，说明这些疾病之间存在一定的关联关系。 对这些关系进行论证，结果表 明，组合药物网络是发现疾病关联关系的一种有效手段。 关键词：组合药物；聚类分析；药物模块；疾病关联关系 － － － 中图分类号：Ｑ３１　 　 文献标志码：Ａ　 　 文章编号：１６７２ ５５６５（２０１７）０１ ０４６ ０９ Ｄｉｓｅａｓｅｓ ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ａｎａｌｙｓｉｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｄｒｕｇ ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ ｎｅｔｗｏｒｋ ＺＨＡＯ Ｙｕａｎｙｕａｎ ，ＷＡＮＧ Ｙｕｎ∗ （Ｃｈｉｎｅｓｅ Ｐｈａｒｍａｃｙ Ｃｏｌｌｅｇｅ，Ｂｅｉｊｉｎｇ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，Ｂｅｉｊｉｎｇ １００１０２，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｄｒｕｇ ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｆｏｒｍｓｔｈｅｃｌｏｓｅｌｉｎｋｗｉｔｈｍｕｌｔｉｔａｒｇｅｔｓａｎｄｍｕｌｔｉｒｉｎｇｓｉｎｔｈｅｔｒｅａｔｍｅｎｔｏｆ ｃｏｍｐｌｅｘｄｉｓｅａｓｅｓ， ｔｈｅ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｅｆｆｅｃｔ ｉｓ ｂｅｔｔｅｒ ｔｈａｎ ｔｈａｔ ｏｆ ｔｈｅ ｓｉｎｇｌｅ ｍｅｄｉｃｉｎｅ． Ｅａｃｈ ｓｉｎｇｌｅ ｄｒｕｇ ｉｎ ｄｒｕｇ ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ ｗｉｔｈ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｆｕｎｃｔｉｏｎｓｉｓｍｏｒｅｅｆｆｅｃｔｉｖｅａｆｔｅｒｃｏｍｂｉｎｅｄ，ｓｕｇｇｅｓｔｉｎｇｔｈｅｒｅｍａｙｂｅｓｏｍｅｋｉｎｄｏｆｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓｂｅｔｗｅｅｎｔｈｅｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇ ｄｉｓｅａｓｅｓ．Ｂｙ ｓｔｕｄｙｉｎｇｔｈｅａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｏｆ ｄｉｓｅａｓｅｓ，ｉｔ’ｓｐｏｓｓｉｂｌｅｔｏｆｉｎｄａｎｅｗｔａｒｇｅｔｆｏｒｔｈｅｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｃｅｒｔａｉｎｄｉｓｅａｓｅｓ， ｓｏ ａｓｔｏ ｍａｋｅ ｎｅｗ ｐｒｏｇｒｅｓｓ ｉｎ ｔｈｅ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ｎｅｗ ｄｒｕｇｓ． Ｔｈｉｓ ｐａｐｅｒ ｉｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｔｈｅ ｎｅｔｗｏｒｋ ｏｆ ｄｒｕｇ ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄｗｉｔｈ ｄａｔａ ｓｏｕｒｃｅ ｆｒｏｍ ＤＣＤＢ （ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ ｄｒｕｇ ｄａｔａｂａｓｅ） ａｎｄ ｇｅｔｓ ３３ ｄｒｕｇ ｍｏｄｕｌｅｓ ｔｈｒｏｕｇｈ ｔｈｅ ｎｅｔｗｏｒｋ ｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇ ａｌｇｏｒｉｔｈｍ．Ｔｈｅｒｅ ａｒｅ７ｇｒｏｕｐｓｏｆ ｄｒｕｇ ｍｏｄｕｌｅｓａｍｏｎｇ ｔｈｅｍａｒｅｕｓｅｄｔｏｔｒｅａｔ ｔｗｏ ｏｒ ｍｏｒｅ ｄｉｓｅａｓｅｓ，ｓｕｇｇｅｓｔｉｎｇ ａ ｃｅｒｔａｉｎ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ｂｅｔｗｅｅｎ ｔｈｅｓｅ ｄｉｓｅａｓｅｓ． Ｄｅｍｏｎｓｔｒａｔｅ ｔｈｅｓｅ