原子力显微镜观测生物大分子图像的一种处理方法鄢.pdfVIP

物理学报摇 粤糟贼葬孕澡赠泽援杂蚤灶援摇 灾燥造援远园袁晕燥援怨 渊圆园员员冤摇 园怨愿苑园猿 原子力显微镜观测生物大分子图像的一种处理方法鄢 覮 覭 季摇 超摇 张凌云 摇 窦硕星摇 王鹏业 渊中国科学院物理研究所软物质重点实验室袁北京摇 员园园员怨园冤 渊圆园员员年员月圆员 日收到曰圆园员员年圆月员远 日收到修改稿冤 摇 摇 针对具有复杂结构的生物大分子图像袁本文改进了已有的半自动化方法袁设计了一种新的算法去消除背 景噪声袁目的在于能够从生物大分子图像高效准确地提取量化信息援通过利用这种新的处理程序对生物大分 子 阅晕粤原子力显微镜图像进行了研究袁不仅可以对线性构像的 阅晕粤 图像进行了处理袁而且对于具有分支构 像复杂 阅晕粤 图像也能够处理援本文所提出的数字图像处理方法具有普适性袁它也可以被应用到其他成像 领域援 关键词院原子力显微镜袁数字图像处理袁阅晕粤 孕粤悦杂院愿苑郾远源郾阅扎袁愿苑郾缘苑郾晕原袁愿苑郾员源郾早噪 阅晕粤分子的生物学和物理学特性有至关重要的意 员郾 引 言 义咱苑袁愿暂 袁正因如此袁原子力显微镜的使用对生物大分 子的定量研究带来革命性的变化咱怨袁员园暂援原子力显微 在近员园年来袁越来越多的物理学技术和理论加 镜是借助于尖锐而且富有弹性的探针袁通过探针针 入到生物领域的研究袁研究过程中袁使用量化的研 尖与 阅晕粤 分子的相互作用袁使得探针悬臂产生扭 究手段就变得越来越重要咱员袁圆暂 袁其中对于生物体中 曲袁将改变激光在光电二极管反射位置袁光信号转 最重要的遗传因子阅晕粤 的研究也更多袁更深入袁相 化为电信号袁通过计算机获得表面形貌图像咱员员暂援基 应的量化信息采集与分析也就愈加有用和重 于这个原理袁原子力显微镜不仅可以对固定在云母 要咱猿袁源暂援在 阅晕粤 分子大小的分析上袁电泳分析是使 表面的 阅晕粤分子袁而且可以对在生物缓冲液中的 用最为广泛的方法援但是电泳在实验过程中有诸多 阅晕粤分子能够实施动态的观测咱员圆暂援另外一方面袁原 的限制袁在通常的电泳分析实验中袁往往要经过超 子力显微镜具有高信噪比的优势袁能够在纵向得到 过圆澡 的实验时间袁而且最为致命的是电泳实验分 表面上阅晕粤生物分子园郾员灶皂高度分辨率的信息和 析所使用的阅晕粤量必须足够多袁才能得到比较准确 横向员要员园灶皂宽度分辨率的信息袁并且能够直接观 咱缘袁远暂 的结果援另外一个方法就是借助于光学显微镜 袁 测阅晕粤片段的整体形貌图像援 在阅晕粤分子上进行荧光染色袁使用光学显微镜观测 综上所述袁得益于原子力显微镜观测技术袁我 荧光染料处理后的 阅晕粤袁从而计算得到 阅晕粤 长度 们能够清晰的观测到阅晕粤片段分子的形貌特征袁接 信息袁这种方法能够提供高分辨率尧低样品量尧高产 下来我们面临的挑战就是如何从 阅晕粤形貌构像图 能袁但是对于小于远园园遭责 的阅晕粤 片段无法提供准 中获取准确的信息援近些年来袁利用原子力显微镜 确的尧清晰的信息援 同时我们应该注意到这两种常 图像开发出半自动和自动化算法援半自动化的算法 用的方法都需要对阅晕粤分子进行荧光染色袁而染色 一种是需要操作人员在粤云酝 图像上袁沿着 阅晕粤 的 后的阅晕粤结构会发生变化袁使所得到的 阅晕粤 片段 轮廓袁在阅晕粤片段上标记不连续的点袁然后将选择 量化