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http:/ / journal.gxzw.gxib.cn
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Guihaia Apr. 2016ꎬ36(4):456 461 -
http:/ / www.guihaia journal.com
DOI:10.11931/ guihaia.gxzw201410011
刘洪伟ꎬ杨艳芳ꎬ李艳艳ꎬ等. 榛子产紫杉醇内生真菌Penicillium aurantiogriseum 中GGPP合酶基因的克隆与表达[J]. 广西植物ꎬ2016ꎬ36(4):
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456 461
LIUHWꎬYANGYFꎬLIYYꎬetal.CloningandexpressionoftheGGPP synthasegenefromthepaclitaxel ̄producingendophyticfungus (Penicilliumauran ̄
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tiogriseum) in Corylus avellana[J]. Guihaiaꎬ2016ꎬ36(4):456 461
榛子产紫杉醇内生真菌Penicillium aurantiogriseum
中GGPP合酶基因的克隆与表达
刘洪伟ꎬ杨艳芳ꎬ李艳艳ꎬ王 帅ꎬ邱德有∗
(林木遗传育种国家重点实验室ꎬ中国林业科学研究院林业研究所ꎬ北京 100091 )
摘 要:牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶是产紫杉醇内生真菌紫杉醇合成下游途径中的关键步骤之一ꎬ在榛子
-
产紫杉醇内生真菌中进行紫杉醇生物合成研究时首先要确认 GGPP合酶的存在ꎮ 该研究通过RT PCR方法
克隆得到了榛子产紫杉醇内生真菌Penicillium aurantiogriseum 中GGPP 合酶基因PaGGPPS (GenBank登录号
为KM881430)的cDNA 开放阅读框 (Open reading frameꎬORF)ꎮ 利用生物信息学方法ꎬ我们分析了该基因的
序列ꎬ并对其编码的氨基酸序列进行了预测ꎮ 结果发现该基因ORF长度为1113 bpꎬ预计蛋白分子量为40.98
kDꎬ等电点为6.168ꎬ表明该蛋白呈酸性ꎮ 对其进行亲疏水性分析发现肽链整体呈现为亲水性ꎮ PaGGPPS 的
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主要二级结构元件为α 螺旋ꎬ并且包含一个异戊二烯类化合物合酶功能域ꎮ 对榛子产紫杉醇内生真菌与其
他物种的GGPPS进行氨基酸同源性分析ꎬ发现其与娄地青霉、曲霉菌和费氏新萨托菌的一致性较高ꎬ分别为
94%、76%和76%ꎮ 进化树分析表明来自动物、真菌和酵母的GGPPS聚为一类ꎬ来自植物的GGPPS聚为一类ꎬ
其中榛子产紫杉醇内生真菌的GGPPS和青霉菌的进化关系最近ꎬ与植物的GGPPS 的进化关系最远ꎮ 对其进
行基础生物信息学分析后ꎬ我们构建了原核表达载体ꎬ成功诱导其表达并得到可溶性蛋白ꎮ 该研究结果为下
一步深入研究GGPPS基因在内生真菌Penicilliumaurantiogriseum紫杉醇合成途径中的作用及和构建高产紫杉
醇基因工程菌株奠定了一定的基础ꎮ
关键词:内生真菌ꎬGGPP合酶ꎬ原核表达ꎬ基因克隆ꎬ紫杉醇
中图分类号:Q943.2 文献标识码:A 文章编号:1000 ̄3142(2016)04 ̄0456 ̄06
Cloning and expression of the GGPP synthase gene
from the paclitaxel ̄produc
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