条纹斑竹鲨线粒体控制区和细胞色素b基因序列分析.pdfVIP

条纹斑竹鲨线粒体控制区和细胞色素b基因序列分析.pdf

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研究报告 R EPOR T S 条纹斑竹鲨线粒体控制区和细胞色素 b 基因序列分析 1 ,2 1 2 1 2 谢仰杰 ,苏永全 ,翁朝红 ,王  军 ,王志勇 ( 1. 厦门大学 海洋与环境学院 ,福建 厦门36 1005 ;2 . 集美大学 水产学院 ,福建省高校水产科学技术与食品 安全重点实验室 ,福建 厦门 36 102 1) 摘要 :对厦门和湛江海域的条纹斑竹鲨[ Chi loscy l l i um p l ag ios um (Bennett , 1830) ] 的线粒体 DN A 控制区和 ( ) Pro 细胞色素 b Cyt b 基因进行 PCR 扩增和测序 , 获得线粒体 DN A 控制区、Cyt b 基因和 t RN A 基因全序 ( ) Pro 列 GenBank序列号 : EU 363740~EU 363752 。结果表明 ,t RN A 基因长度为 69 bp ,控制区长度为 1 094 ~ 1 096 bp ,Cyt b 基因全序列长度为 1 146 bp 。t RN A Pro 基因非常保守 ,未发现碱基变异 。所测 30 个个体中 , 控制区只有 4 个多态位点 ,5 种不同的单倍型 ; Cyt b 基因全序列共有 10 个多态性位点 ,7 种单倍型 。Cyt b 基因的 1 146 个碱基编码 381 个氨基酸 ,氨基酸链共有 3 个变异位点 ,4 种单倍型 , 厦门群体具有 4 种单倍 型 ,湛江群体只有 1 种单倍型 。综合 Cyt b 基因和控制区序列 ,2 个条纹斑竹鲨群体共有 10 种单倍型 ,其中 厦门群体有 9 种单倍型 ,湛江群体仅 4 种单倍型 。研究结果表明条纹斑竹鲨在控制区和 Cyt b 基因序列上的 遗传多样性均较低 ,厦门群体的遗传多样性水平高于湛江群体 。 ( ) ( ) 关键词 :条纹斑竹鲨[ Chi loscy l l i um p l ag ios um Bennett ,1830 ] ;线粒体 DN A ;控制区;细胞色素 b Cyt b 中图分类号 :Q959 . 423      文献标识码 :A      文章编号 (2008)   条纹斑竹鲨 [ Ch i l oscy l l i um p l ag ios um (Ben 1  材料和方法 ) ( net t ,1830 ] ,俗称狗鲨 、犬鲨 , 归属于须鲨 目 Orec ) ( ) tolobifor me s , 斑竹 鲨科 Hemi scyliidae , 斑竹 鲨 1 . 1  材料来源 属[ 1 ,2 ] 。分布于中国、日本 、菲律宾、泰国、马来半岛、 试验所用条纹斑竹鲨分别采 自厦门海域和湛江 印度及非

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