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Nucleosome movement catalyzed by nucleosome remodeling activities Effects of histone tail modifications Chromatin remodeling complexes and histone modifying enzymes work together to alter chromatin structure RNA聚合酶Ⅱ起始转录后,在最初(mRNA长度~20nt)阶段可以 与其它转录因子(DSIF与NELF)结合而使转录发生短暂的停止, 此时催化mRNA 5’端鸟嘌呤甲基修饰的酶系统通过与CTD相互作用而 可以对mRNA 5’端修饰;加帽修饰完成后,暂停的转录装置在p-TEFb 的作用下使CTD中的Ser-2发生磷酸化,同时磷酸化酶(small CTD phsophotase, SCPs)可以去除Ser-5的磷酸化,磷酸化状态的转变及 DSIF中SPT5亚基的磷酸化及甲基化修饰可以协同去除NLEF对转录 的抑制,使转录重新进入延伸过程。 真核基因转录延伸: 其它一些蛋白质因子如TFⅡS与FACT(facilitate chromatin transcription)等也在 转录延伸中发挥重要作用。 TFⅡS可以减少转录延伸过程中RNA聚合酶Ⅱ在某些 位点的停留时间而增加总体的转录速度;其次,TFⅡS还可以激活RNA聚合酶Ⅱ 内在的RNase活性,从而去除因错误加合的核苷酸,提高转录的精确性,和Gre 类似。 FACT复合物是目前为止体外证明可以协助RNA聚合酶Ⅱ转录通过 核小体模板的转录延伸因子,主要是通过置换去除核小体中H2A/H2B二体,破坏 完整核小体结构而使聚合酶Ⅱ顺利转录通过;又可以重新恢复被转录通过核小体 的结构(具有组蛋白分子伴侣活性)。在转录过程结束时,磷酸酶SSU72及 Fcp1分别可以特异性地去除RNA聚合酶ⅡCTD中Ser-5与Ser-2的磷酸化修饰而 使聚合酶得以循环使用。 Role of CTD phosphrylation during transcription cylce RNA processing enzymes are recruited by the tail of polymerase 在转录延伸过程中,随着RNA聚合酶Ⅱ CTD磷酸化状态的改变,参与mRNA剪接 修饰的蛋白因子会通过与CTD的相互作用使这些过程与转录延伸相偶联。这些 RNA处理过程包括:1)RNA 5’端的加帽;2)剪接;3)RNA 3’的多聚腺苷酰化; RNA 5’端的加帽反应包括三步酶促反应:1) RNA 5’端的一个磷酸基团被RNA 三磷酸化酶(RNA triphosphotase)去除;2)鸟苷酰转移酶(guanylyl transferase) 催化RNA 5’端的β-磷酸基团对GTP α-磷酸基团的亲核攻击,形成新的5‘-5’磷酸 二酯键;3)在甲基转移酶的作用下使鸟嘌呤碱基7位上形成甲基修饰。 The structure and formation of the 5’RNA cap 真核生物基因mRNA 3’末端加尾处理与转录终止是紧密相连的。在被转录基因的 3‘末端具有特定的聚A信号序列(AAUAAA),当这种序列被转录产生RNA后,可 以促使结合在RNA聚合酶CTD上的聚腺苷酰酶(poly-A polymerase)复合物转移 到新产生的RNA上,并引起mRNA在聚A信号序列后的切割断裂,发生聚A反应, 并转录终止。在介导mRNA切割断裂与聚A反应过程中有两种重要蛋白因子-CPSF (cleavage and polyadenylation specificity factor)与CstF(cleavage stimulation factor); 而RNA聚合酶在mRNA被切割后仍可以继续转录,但在一种5‘ 3’核酸外切酶 (人Xrn2;酵母Rat1)的作用下被终止转录。 Polyadenylation and termination Detailed poly-adenylation reaction * Francis Crick在1958年提出中心法则,指出信息传递是单向过程,一 旦转变为蛋白质,就不会从蛋白质转回到核酸分子,但遗传信息可 以从核酸到核酸或从核酸到蛋白质. 遗传信息从DNA经过RNA传递到蛋白质的过程称为基因表达 (gene expression)。 任何能较为直接影响转录和翻译过程开启/关闭及发生速率的因素及 其作用过程,称为基因表达调控(regulation of gene expression)。 可以在多层次或水平上进行,如转录起始,转
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